RNA–Protein interactions for RNA: tS(GCU)Q1

tS(GCU)Q1, Transcript of Mitochondrial serine tRNA (tRNA-Ser), yeastyeast

Gene tS(GCU)Q1, Length 86 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 EGD2P38879 174 aaKnown RBP-3.65□□□□□ -2.99
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP-3.65□□□□□ -2.99
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GRX8Q05926 109 aa-3.66□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ECM12O13529 151 aa-3.67□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP-3.67□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 QCR7P00128 127 aa-3.68□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PAU21P0CE86 164 aa-3.68□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PAU22P0CE87 164 aa-3.68□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YLR118CQ12354 227 aa-3.68□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPC19P28000 142 aaKnown RBP-3.69□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa-3.69□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa-3.69□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa-3.69□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP-3.69□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa-3.69□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1B-JR1P47098 1755 aa-3.69□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP-3.69□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP-3.69□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1B-ER1Q03612 1755 aa-3.69□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1B-DR1Q03855 1755 aa-3.69□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP-3.69□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP-3.69□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1B-GR1Q12141 1755 aa-3.69□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1B-GR2Q12269 1755 aa-3.69□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1B-OLQ12273 1755 aa-3.69□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP-3.69□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1B-ORQ92393 1755 aa-3.69□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1B-DR3Q99231 1755 aa-3.69□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MEC1P38111 2368 aa-3.7□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YER181CP40097 107 aa-3.7□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LSM8P47093 109 aaKnown RBP-3.7□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MIC10Q96VH5 97 aa-3.7□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PET54P10834 293 aa-3.72□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SEC59P20048 519 aa-3.72□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PAM16P42949 149 aa-3.72□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SDH7Q04401 133 aa-3.72□□□□□ -3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YBL044WP38194 122 aa-3.73□□□□□ -3.01
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SHG1P38337 142 aa-3.73□□□□□ -3.01
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DLS1P40366 167 aa-3.73□□□□□ -3.01
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LSM1P47017 172 aaKnown RBP-3.73□□□□□ -3.01
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPL38P49167 78 aaKnown RBP-3.73□□□□□ -3.01
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ORM1P53224 222 aa-3.73□□□□□ -3.01
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RAD50P12753 1312 aa-3.73□□□□□ -3.01
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 QCR10P37299 77 aa-3.74□□□□□ -3.01
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HSP12P22943 109 aaKnown RBP-3.75□□□□□ -3.01
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RGI1P40043 161 aaPredicted RBP-3.76□□□□□ -3.01
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BPH1P25356 2167 aa-3.77□□□□□ -3.01
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPL30P14120 105 aaKnown RBP-3.77□□□□□ -3.01
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PDX3P38075 228 aaKnown RBP-3.77□□□□□ -3.01
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HSK3P69852 69 aa-3.77□□□□□ -3.01
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CBF1P17106 351 aa-3.78□□□□□ -3.01
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LSM3P57743 89 aaKnown RBP-3.78□□□□□ -3.01
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YDR476CQ03362 224 aa-3.78□□□□□ -3.01
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP-3.78□□□□□ -3.01
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MSS2P40990 351 aa-3.79□□□□□ -3.02
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PGA2P53903 129 aa-3.79□□□□□ -3.02
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YRF1-1P0CX20 1796 aa-3.79□□□□□ -3.02
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YRF1-5P0CX21 1796 aa-3.79□□□□□ -3.02
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YRF1-8P0CX22 1796 aa-3.79□□□□□ -3.02
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YIL014C-AQ02598 104 aa-3.8□□□□□ -3.02
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AIM11P87275 137 aa-3.81□□□□□ -3.02
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DNA2P38859 1522 aa-3.81□□□□□ -3.02
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CMD1P06787 147 aaKnown RBP-3.82□□□□□ -3.02
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YCR101CP25607 182 aa-3.82□□□□□ -3.02
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YGR201CP42936 225 aa-3.82□□□□□ -3.02
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IMP2P46972 177 aa-3.82□□□□□ -3.02
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SNO1Q03144 224 aa-3.82□□□□□ -3.02
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NSL1Q12143 216 aa-3.82□□□□□ -3.02
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YLR363W-AQ3E747 85 aa-3.82□□□□□ -3.02
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPL14AP36105 138 aaKnown RBP-3.83□□□□□ -3.02
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ROX3P25046 220 aa-3.84□□□□□ -3.02
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TRS20P38334 175 aa-3.84□□□□□ -3.02
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP-3.85□□□□□ -3.03
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SLO1Q3E784 85 aa-3.85□□□□□ -3.03
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SSN2P38931 1420 aa-3.86□□□□□ -3.03
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HMRA2P0CY13 119 aa-3.87□□□□□ -3.03
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPO21P04050 1733 aaKnown RBP-3.87□□□□□ -3.03
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TRM732Q03496 1420 aa-3.87□□□□□ -3.03
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YJL197C-AP0C5P0 93 aa-3.88□□□□□ -3.03
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DER1P38307 211 aa-3.88□□□□□ -3.03
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RSM18P40033 138 aa-3.88□□□□□ -3.03
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 APQ12P40532 138 aa-3.88□□□□□ -3.03
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YGR042WP53227 271 aa-3.89□□□□□ -3.03
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BUD4P47136 1447 aa-3.89□□□□□ -3.03
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YKT6P36015 200 aaKnown RBP-3.9□□□□□ -3.03
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPL038W-AQ3E7B4 63 aa-3.9□□□□□ -3.03
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MMS1Q06211 1407 aa-3.92□□□□□ -3.04
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPL35AP0CX84 120 aaKnown RBP-3.92□□□□□ -3.04
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPL35BP0CX85 120 aaKnown RBP-3.92□□□□□ -3.04
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MIX14Q04341 121 aa-3.92□□□□□ -3.04
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YER187WP40102 141 aa-3.93□□□□□ -3.04
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YBR292CP38357 123 aa-3.94□□□□□ -3.04
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ERV14P53173 138 aa-3.95□□□□□ -3.04
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MRX7P53869 86 aa-3.96□□□□□ -3.04
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 COX12Q01519 83 aa-3.96□□□□□ -3.04
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ICY1Q04329 127 aa-3.96□□□□□ -3.04
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YOL118CQ08259 102 aa-3.96□□□□□ -3.04
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YDR210WQ03482 75 aa-3.97□□□□□ -3.04
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CNL1Q06333 122 aa-3.97□□□□□ -3.04
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YCR050CP25630 102 aa-3.98□□□□□ -3.05
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 52.9 ms