RNA–Protein interactions for RNA: YNR040W

YNR040W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YNR040W, Length 771 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNR040W	YNR040W	SEC11	P15367	167 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	INO2	P26798	304 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	APS1	P35181	156 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	UIP3	P39547	235 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	TOS8	P53147	276 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	CWC27	Q02770	301 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	SRL1	Q08673	210 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	VPS55	P47111	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	SPG4	Q04438	115 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	HOR7	Q05827	59 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	RRG8	Q06109	277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	ATG39	Q06159	398 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	YCR023C	P25351	611 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	POP7	P38291	140 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	KEG1	P43614	200 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	LCB3	P47013	409 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	YML122C	Q03207	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	TVP18	Q04767	167 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	UTR5	P32630	166 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	YKR032W	P36127	104 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	YIP3	P53633	176 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	ATP23	P53722	227 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	BET5	Q03630	159 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	MIG1	P27705	504 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	PET8	P38921	284 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	VPS71	Q03433	280 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	YML079W	Q03629	201 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	SAL1	D6W196	494 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	PFY1	P07274	126 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	RPB9	P27999	122 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	YER076C	P40049	302 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	SPI1	P40092	148 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	AGE2	P40529	298 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	CIN5	P40917	295 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	PRM3	Q08931	133 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	CCW12	Q12127	133 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	AGA1	P32323	725 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	YKL044W	P36092	106 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	AIM29	P36154	155 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	YHR022C	P38763	256 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	MST28	P39552	234 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	MIC26	P50087	233 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	MGR2	Q02889	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	PRM7	Q12459	698 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	MRP49	P32388	137 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	YGR025W	P53216	100 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	CAX4	P53223	239 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	YDR366C	P87287	132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	YER135C	P40082	130 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	TOS6	P48560	102 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	YPR013C	Q12145	317 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	Q0255	P03881	472 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	GLO1	P50107	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	RUB1	Q03919	77 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	DGA1	Q08650	418 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	VAR1	P02381	398 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	YCR041W	P37265	110 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	YPL073C	P40323	161 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	TEL1	P38110	2787 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	SIM1	P40472	476 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	DCV1	P43595	202 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	ALG13	P53178	202 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	YPL261C	Q08976	102 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNR040W	YNR040W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YNR040W	YNR040W	YKL070W	P36087	169 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNR040W	YNR040W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YNR040W	YNR040W	MIG3	P39943	394 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNR040W	YNR040W	AIM34	Q03673	198 aa		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.6 ms