RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	PEX22	P39718	180 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	HAC1	P41546	238 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	TAD2	P47058	250 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	YCL001W-A	P87012	153 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YNL057W	YNL057W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	YOR105W	Q08504	108 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	MRP49	P32388	137 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	MRPS9	P38120	278 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	YBR209W	P38311	105 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	YHR140W	P38842	239 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	YGL149W	P53116	101 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	YGL088W	P53151	121 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	ATG33	Q06485	197 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	ANT1	Q06497	328 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	OST3	P48439	350 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	PAU4	P53427	120 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	TVP18	Q04767	167 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	YER076C	P40049	302 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	YER085C	P40058	173 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	CYB5	P40312	120 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	RPC10	P40422	70 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	SRB7	P47822	140 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	ATP19	P81451	68 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	CSM4	Q08955	156 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	FMP16	Q12497	93 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	YBR085C-A	O43137	85 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	PAU1	P0CE88	120 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	PAU14	P0CE89	120 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	PAU6	P0CE90	120 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	PAU18	P0CE91	120 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	PAU8	P0CE92	120 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	PAU11	P0CE93	120 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	YKL070W	P36087	169 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	PAU13	P38725	120 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	VMA7	P39111	118 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	DCV1	P43595	202 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	PAU10	Q03050	120 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	GPI19	Q04082	140 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	PAU20	Q08322	120 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	PAU9	Q3E770	120 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	ECM12	O13529	151 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	MSK1	P32048	576 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	RPB11	P38902	120 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	SDS23	P53172	527 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	ENV10	Q99382	181 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YNL057W	YNL057W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	CDC43	P18898	376 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	RIB5	P38145	238 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	HIT1	P46973	164 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	GLO1	P50107	326 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	ZRT1	P32804	376 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	AIM29	P36154	155 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	MOG1	P47123	218 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	ATP14	Q12349	124 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	COX19	Q3E731	98 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	CMC4	Q3E7A9	73 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	SDH8	P38345	138 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	SPC25	P40014	221 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	2.69	□□□□□ -1.98	not detected
YNL057W	YNL057W	CWP2	P43497	92 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	SNN1	P48232	102 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	UBC12	P52491	188 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	GTO3	Q04806	366 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	NAT3	Q06504	195 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	YLR118C	Q12354	227 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	YLR156W	P0CE96	114 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	YLR159W	P0CE97	114 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	YLR161W	P0CE98	114 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	YBR219C	P38317	127 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	SHG1	P38337	142 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	SRP14	P38985	146 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	YGR149W	P48236	432 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	GIM5	Q04493	163 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	KTI11	Q3E840	82 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	YLR415C	O13578	112 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	SRP21	P32342	167 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	QRI5	P32344	111 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	DAD3	P69850	94 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YNL057W	YNL057W	UBC4	P15731	148 aa		2.66	□□□□□ -1.98

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.8 ms