RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeastyeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11YML043C YOR186WQ08560 144 aa3.47□□□□□ -1.85
RRN11YML043C GGC1P38988 300 aa3.46□□□□□ -1.86
RRN11YML043C RRT13P40042 185 aa3.46□□□□□ -1.86
RRN11YML043C YIL163CP40448 117 aa3.46□□□□□ -1.86
RRN11YML043C GAT4P40569 121 aa3.46□□□□□ -1.86
RRN11YML043C FLO9P39712 1322 aa3.46□□□□□ -1.86
RRN11YML043C AQY1P0CD91 305 aa3.45□□□□□ -1.86
RRN11YML043C QCR9P22289 66 aa3.45□□□□□ -1.86
RRN11YML043C BET1P22804 142 aa3.45□□□□□ -1.86
RRN11YML043C REC114P32841 428 aa3.45□□□□□ -1.86
RRN11YML043C YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data3.45□□□□□ -1.86not detected
RRN11YML043C YBL081WP38180 368 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RRN11YML043C OST1P41543 476 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RRN11YML043C SHH4Q06236 168 aa3.45□□□□□ -1.86
RRN11YML043C SUT2Q12286 268 aa3.45□□□□□ -1.86
RRN11YML043C YDR381C-AQ3E6R5 114 aa3.45□□□□□ -1.86
RRN11YML043C PIS1P06197 220 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RRN11YML043C RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RRN11YML043C RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RRN11YML043C RPL30P14120 105 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RRN11YML043C IMP1P28627 190 aa3.44□□□□□ -1.86
RRN11YML043C ERG2P32352 222 aa3.44□□□□□ -1.86
RRN11YML043C SFT2P38166 215 aa3.44□□□□□ -1.86
RRN11YML043C YGR269WP40326 108 aa3.44□□□□□ -1.86
RRN11YML043C YNL046WP53956 172 aa3.44□□□□□ -1.86
RRN11YML043C HAL1Q01766 294 aa3.44□□□□□ -1.86
RRN11YML043C YMR007WQ03675 126 aa3.44□□□□□ -1.86
RRN11YML043C LSM6Q06406 86 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RRN11YML043C MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RRN11YML043C ECM15P35195 104 aa3.44□□□□□ -1.86
RRN11YML043C SRX1P36077 127 aa3.44□□□□□ -1.86
RRN11YML043C RSM19P53733 91 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RRN11YML043C TIM18Q08749 192 aa3.44□□□□□ -1.86
RRN11YML043C EMC6Q12431 108 aa3.44□□□□□ -1.86
RRN11YML043C YPR064WQ12492 139 aa3.44□□□□□ -1.86
RRN11YML043C RRT15Q3E811 62 aa3.44□□□□□ -1.86
RRN11YML043C RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RRN11YML043C RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RRN11YML043C CSE2P33308 149 aa3.43□□□□□ -1.86
RRN11YML043C APS1P35181 156 aa3.43□□□□□ -1.86
RRN11YML043C RPL32P38061 130 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RRN11YML043C CSH1P38287 376 aa3.43□□□□□ -1.86
RRN11YML043C ATP23P53722 227 aa3.43□□□□□ -1.86
RRN11YML043C SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RRN11YML043C NIP7Q08962 181 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RRN11YML043C YDL211CQ12121 372 aa3.43□□□□□ -1.86
RRN11YML043C MIC10Q96VH5 97 aa3.43□□□□□ -1.86
RRN11YML043C HTL1Q9URQ5 78 aa3.43□□□□□ -1.86
RRN11YML043C SWD3P38123 315 aa3.42□□□□□ -1.86
RRN11YML043C DSE2P38844 325 aa3.42□□□□□ -1.86
RRN11YML043C YEL073CP39974 107 aa3.42□□□□□ -1.86
RRN11YML043C VHS2P40463 436 aa3.42□□□□□ -1.86
RRN11YML043C CDC1P40986 491 aa3.42□□□□□ -1.86
RRN11YML043C YPI1P43587 155 aa3.42□□□□□ -1.86
RRN11YML043C PIR5P46999 287 aa3.42□□□□□ -1.86
RRN11YML043C SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RRN11YML043C RRS1Q08746 203 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RRN11YML043C FPR2P32472 135 aa3.41□□□□□ -1.86
RRN11YML043C SPT4P32914 102 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RRN11YML043C MED6P38782 295 aa3.41□□□□□ -1.86
RRN11YML043C YER187WP40102 141 aa3.41□□□□□ -1.86
RRN11YML043C LST8P41318 303 aa3.41□□□□□ -1.86
RRN11YML043C YFL019CP43576 117 aa3.41□□□□□ -1.86
RRN11YML043C YDR102CQ03864 110 aa3.41□□□□□ -1.86
RRN11YML043C YPR011CQ12251 326 aa3.41□□□□□ -1.86
RRN11YML043C RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
RRN11YML043C RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
RRN11YML043C ROX3P25046 220 aa3.4□□□□□ -1.86
RRN11YML043C RPL16BP26785 198 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
RRN11YML043C YEL067CP39978 195 aa3.4□□□□□ -1.86
RRN11YML043C SIM1P40472 476 aa3.4□□□□□ -1.86
RRN11YML043C EAF6P47128 113 aa3.4□□□□□ -1.86
RRN11YML043C YNR077CP53758 84 aa3.4□□□□□ -1.86
RRN11YML043C YNL234WP53857 426 aa3.4□□□□□ -1.86
RRN11YML043C PIR1Q03178 341 aa3.4□□□□□ -1.86
RRN11YML043C MIX14Q04341 121 aa3.4□□□□□ -1.86
RRN11YML043C IRC23Q08416 157 aa3.4□□□□□ -1.86
RRN11YML043C YPL261CQ08976 102 aa3.4□□□□□ -1.86
RRN11YML043C TDA8Q6B2U8 126 aa3.4□□□□□ -1.86
RRN11YML043C RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RRN11YML043C RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RRN11YML043C RPL16AP26784 199 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RRN11YML043C PEX17P40155 199 aa3.39□□□□□ -1.87
RRN11YML043C UBC13P52490 153 aa3.39□□□□□ -1.87
RRN11YML043C SWS2P53937 143 aa3.39□□□□□ -1.87
RRN11YML043C YER145C-AA0A023PYF4 145 aa3.39□□□□□ -1.87
RRN11YML043C YHR213WP0CI67 198 aa3.39□□□□□ -1.87
RRN11YML043C MXR2P25566 168 aa3.39□□□□□ -1.87
RRN11YML043C TIM12P32830 109 aa3.39□□□□□ -1.87
RRN11YML043C YSY6P38374 65 aa3.39□□□□□ -1.87
RRN11YML043C YIL029CP40538 142 aa3.39□□□□□ -1.87
RRN11YML043C YIA6P40556 373 aa3.39□□□□□ -1.87
RRN11YML043C YFL051CP43552 160 aa3.39□□□□□ -1.87
RRN11YML043C NRM1P53718 249 aa3.39□□□□□ -1.87
RRN11YML043C ATP19P81451 68 aa3.39□□□□□ -1.87
RRN11YML043C PGU1P47180 361 aa3.38□□□□□ -1.87
RRN11YML043C PBP4Q07362 185 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RRN11YML043C YOR376W-AQ3E805 51 aa3.38□□□□□ -1.87
RRN11YML043C PFY1P07274 126 aa3.37□□□□□ -1.87
RRN11YML043C YGL034CP53186 121 aa3.37□□□□□ -1.87
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