RNA–Protein interactions for RNA: YJL059W

YHC3, Transcript of Protein required for the ATP-dependent transport of arginine, yeast

Gene YHC3, Length 1,227 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHC3	YJL059W	YCR050C	P25630	102 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YHC3	YJL059W	SRB6	P32570	121 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YHC3	YJL059W	YEL073C	P39974	107 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YHC3	YJL059W	YIR035C	P40579	254 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YHC3	YJL059W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YHC3	YJL059W	KEI1	Q06346	221 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YHC3	YJL059W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	RRT1	P38192	103 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	PAM16	P42949	149 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	NSE4	P43124	402 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	HAL1	Q01766	294 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	MSW1	P04803	379 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	HAP3	P13434	144 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	SCM4	P32564	187 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	GPI11	Q06636	219 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	MRPL44	P19956	98 aa		5	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	YCR099C	P25657	155 aa		5	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	ATP19	P81451	68 aa		5	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	RIM9	Q04734	239 aa		5	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	YMR252C	Q04814	134 aa		5	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	YOL085C	Q99345	113 aa		5	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	PEX4	P29340	183 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	ATG10	Q07879	167 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	MHF2	Q3E829	80 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	YKR032W	P36127	104 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	PAM17	P36147	197 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	YNL217W	P40152	326 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	FLX1	P40464	311 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	PCC1	Q3E833	88 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	MPC3	P53311	146 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	CSI2	Q08054	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YHC3	YJL059W	DYN1	P36022	4092 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	CLB6	P32943	380 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	SNN1	P48232	102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	YFL012W	P43580	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	YOL131W	Q08270	108 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	FZF1	P32805	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	SPO73	P40031	143 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	YFR045W	P43617	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	FIT1	Q04433	528 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	SSS1	P35179	80 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	MID2	P36027	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	YAL064W	P39711	94 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	YHP1	Q04116	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	SCP1	Q08873	200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	IRC23	Q08416	157 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	YHR130C	P38834	111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	HPA3	P39979	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	COA6	Q3E846	104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHC3	YJL059W	COX5B	P00425	151 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
YHC3	YJL059W	YHL042W	P38729	150 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	YIL059C	P40520	121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	PIR1	Q03178	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	RAF1	Q06891	181 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	YOR268C	Q08734	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	YOR385W	Q08909	290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	KRE9	P39005	276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	YFR035C	P43608	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	ERG25	P53045	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
YHC3	YJL059W	YBR013C	P38215	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	UPS3	Q04006	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	FUN14	P18411	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	YHR180W	P38868	163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	IGO1	P53897	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	QCR10	P37299	77 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	DAN1	P47178	298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	YML079W	Q03629	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHC3	YJL059W	SOM1	Q05676	74 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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