RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	HAC1	P41546	238 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	YFR045W	P43617	309 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	YOR015W	Q12169	119 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	FZF1	P32805	299 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	YAL064W	P39711	94 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	PEX22	P39718	180 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	CIN5	P40917	295 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	YCL001W-A	P87012	153 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	DXO1	Q06349	442 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	RPC10	P40422	70 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	EOS1	P53938	366 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	ADD37	Q03233	198 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	YOR105W	Q08504	108 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	YCR043C	P25361	127 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	YBR090C	P38253	122 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	YHR140W	P38842	239 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	TAD2	P47058	250 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	ATP19	P81451	68 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	CYB5	P40312	120 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	YGL149W	P53116	101 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	ANT1	Q06497	328 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	CMC4	Q3E7A9	73 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	MRPS9	P38120	278 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	YER076C	P40049	302 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	OST3	P48439	350 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	PAU4	P53427	120 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	TVP18	Q04767	167 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	RIB5	P38145	238 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	SRB7	P47822	140 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	SDS23	P53172	527 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SYF2	YGR129W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	MSK1	P32048	576 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	DCV1	P43595	202 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	CSM4	Q08955	156 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	ECM12	O13529	151 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	PAU1	P0CE88	120 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	PAU14	P0CE89	120 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	PAU6	P0CE90	120 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	PAU18	P0CE91	120 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	PAU8	P0CE92	120 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	PAU11	P0CE93	120 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	YKL070W	P36087	169 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	YBR209W	P38311	105 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	PAU13	P38725	120 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	MOG1	P47123	218 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	YGL088W	P53151	121 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	PAU10	Q03050	120 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	GPI19	Q04082	140 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	PAU20	Q08322	120 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	PAU9	Q3E770	120 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	ENV10	Q99382	181 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	YBR085C-A	O43137	85 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	SPC25	P40014	221 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	RPB11	P38902	120 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	3.48	□□□□□ -1.85	not detected
SYF2	YGR129W	YER085C	P40058	173 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	YLR118C	Q12354	227 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	SRP21	P32342	167 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	ZRT1	P32804	376 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	YBR219C	P38317	127 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	COX19	Q3E731	98 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYF2	YGR129W	YLR156W	P0CE96	114 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	YLR159W	P0CE97	114 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	YLR161W	P0CE98	114 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	AIM29	P36154	155 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	YGR149W	P48236	432 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	GIM5	Q04493	163 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	KTI11	Q3E840	82 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	QRI5	P32344	111 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	SRP14	P38985	146 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	VMA7	P39111	118 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	UBC4	P15731	148 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	CWP2	P43497	92 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	HIT1	P46973	164 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	GTO3	Q04806	366 aa		3.43	□□□□□ -1.86

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