RNA–Protein interactions for RNA: YOR104W

PIN2, Transcript of Exomer-dependent cargo protein, yeast

Gene PIN2, Length 849 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIN2	YOR104W	YPR013C	Q12145	317 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PIN2	YOR104W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PIN2	YOR104W	HTB2	P02294	131 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	YPT10	P38146	199 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	AME1	P38313	324 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	PHS1	P40857	217 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	LCB3	P47013	409 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	TOM7	P53507	60 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	DAD3	P69850	94 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	CPT1	P17898	393 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	MIC26	P50087	233 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	YGL185C	P53100	379 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	ATP19	P81451	68 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	RAV2	Q03956	351 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	YOR105W	Q08504	108 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	DAD1	Q12248	94 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	PRM7	Q12459	698 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	COQ3	P27680	312 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	LAC1	P28496	418 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	SDH8	P38345	138 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	HSP10	P38910	106 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	YER135C	P40082	130 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	YIL024C	P40543	189 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	DAD4	P69851	72 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	CCW12	Q12127	133 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	POF1	P25576	258 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	MRPS9	P38120	278 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	YIL163C	P40448	117 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	COX16	P47081	118 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	TIM21	P53220	239 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	NAT3	Q06504	195 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	DCN1	Q12395	269 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	BNS1	P50084	137 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	YGR025W	P53216	100 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	COX12	Q01519	83 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	SNO1	Q03144	224 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	UPS3	Q04006	179 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	ORM2	Q06144	216 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	TIR1	P10863	254 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	SRP21	P32342	167 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	HOT13	P36078	116 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	YHR022C	P38763	256 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	UIP3	P39547	235 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	MIG3	P39943	394 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	YER085C	P40058	173 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	HUA1	P40325	198 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	KEG1	P43614	200 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	YFR045W	P43617	309 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	HIT1	P46973	164 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	APS2	Q00381	147 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	ZEO1	Q08245	113 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PIN2	YOR104W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	CNB1	P25296	175 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	YMR141C	P40211	102 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	PGD1	P40356	397 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	MOG1	P47123	218 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	MGA1	P53050	456 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	CSM4	Q08955	156 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	QRI5	P32344	111 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	ELF1	P36053	145 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
PIN2	YOR104W	IRC22	P40006	225 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	SPI1	P40092	148 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	GIM5	Q04493	163 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	GTO3	Q04806	366 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	TIM22	Q12328	207 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	YOP1	Q12402	180 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	YGL010W	P25338	174 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	SRP14	P38985	146 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	PAU15	P40585	124 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	VMA21	P41806	77 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	DIA1	P54005	336 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	YDR366C	P87287	132 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	YLR118C	Q12354	227 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PIN2	YOR104W	VAR1	P02381	398 aa		4.12	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.3 ms