RNA–Protein interactions for RNA: YKL085W

MDH1, Transcript of Mitochondrial malate dehydrogenase, yeast

Gene MDH1, Length 1,005 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDH1	YKL085W	COX19	Q3E731	98 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDH1	YKL085W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDH1	YKL085W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDH1	YKL085W	SEC59	P20048	519 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDH1	YKL085W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MDH1	YKL085W	TIM21	P53220	239 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDH1	YKL085W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDH1	YKL085W	ERV2	Q12284	196 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDH1	YKL085W	PRR2	Q12310	699 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDH1	YKL085W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDH1	YKL085W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	CUP2	P15315	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	CDC43	P18898	376 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	SAS2	P40963	338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	LCL2	Q08045	131 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
MDH1	YKL085W	TRS20	P38334	175 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	DXO1	Q06349	442 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	SPI1	P40092	148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	CGR1	P53188	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	SNO1	Q03144	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	ADD37	Q03233	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	CTR3	Q06686	241 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	ANB1	P19211	157 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	IRC22	P40006	225 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	PAU15	P40585	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	MGA1	P53050	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	VAR1	P02381	398 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	QCR9	P22289	66 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	YBL059W	P34224	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	MRPS9	P38120	278 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	PHS1	P40857	217 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	VMA21	P41806	77 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	DSK2	P48510	373 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	YPS5	P53057	165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	YGR026W	P53217	278 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	PAU4	P53427	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	YMR007W	Q03675	126 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	CRC1	Q12289	327 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	PAU14	P0CE89	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	DER1	P38307	211 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	PAU13	P38725	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	HSP10	P38910	106 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	SUR2	P38992	349 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	NSE4	P43124	402 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	ATP23	P53722	227 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	PAU10	Q03050	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	PAU20	Q08322	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	YLR118C	Q12354	227 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDH1	YKL085W	DAN1	P47178	298 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	FIT2	Q08906	153 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	TOM7	P53507	60 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	AVO2	Q04749	426 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	ATX2	Q12067	313 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	SPO13	P23624	291 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	AHT1	P29589	182 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	YKL070W	P36087	169 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	RRT13	P40042	185 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	YGL185C	P53100	379 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	MRX11	Q03079	207 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	POF1	P25576	258 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	PAU3	P25610	124 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	CDC50	P25656	391 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	HMX1	P32339	317 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	SPC1	P46965	94 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	BNS1	P50084	137 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	APS2	Q00381	147 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	PBA1	Q05778	276 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	YOP1	Q12402	180 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDH1	YKL085W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 113 ms