RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	YDL242W	Q07746	117 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	ISN1	Q99312	450 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	MRS1	P07266	363 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	BET5	Q03630	159 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	YBR013C	P38215	129 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	HUA1	P40325	198 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	AIM34	Q03673	198 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	YDR010C	Q12426	110 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	YPT10	P38146	199 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	YMR141C	P40211	102 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	YIL024C	P40543	189 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	ATC1	Q04005	294 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	AVO2	Q04749	426 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	QCR9	P22289	66 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	CDC50	P25656	391 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	YIL059C	P40520	121 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	MMS2	P53152	137 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	DGA1	Q08650	418 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	YCR023C	P25351	611 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	YEA4	P40004	342 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	MRPL50	P53724	139 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	DID2	P69771	204 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	YMR320W	Q04897	101 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	AHT1	P29589	182 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	CAF40	P53829	373 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYF2	YGR129W	SPO13	P23624	291 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	TRS20	P38334	175 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	AME1	P38313	324 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	YBR242W	P38331	238 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	YHR173C	P38864	112 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	POG1	P40473	351 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	YKE4	P40544	346 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	DAD4	P69851	72 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	RAV2	Q03956	351 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	YDR029W	Q12111	104 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	SUR2	P38992	349 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	COX16	P47081	118 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	UBC5	P15732	148 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	ACP1	P32463	125 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	DIA1	P54005	336 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	PMP3	P87284	55 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	DAD1	Q12248	94 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	TIM22	Q12328	207 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	HMX1	P32339	317 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	YGL185C	P53100	379 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	MRPS16	Q02608	121 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	SEC59	P20048	519 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	SMP1	P38128	452 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	MIX23	P38162	196 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	TEM1	P38987	245 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	YNR066C	P53752	436 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	MHR1	Q06630	226 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	PCC1	Q3E833	88 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF2	YGR129W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	RPL12B	P0CX54	165 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	TIR1	P10863	254 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	ERG28	P40030	148 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	TIM21	P53220	239 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	UPS3	Q04006	179 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	POF1	P25576	258 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	3.64	□□□□□ -1.83	not detected
SYF2	YGR129W	SNA2	P56508	79 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	YLR194C	Q05777	254 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	SDH8	P38345	138 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	PGD1	P40356	397 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	AIM19	P40502	157 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	YGR026W	P53217	278 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	ACB1	P31787	87 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	MRP49	P32388	137 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	YBR292C	P38357	123 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SYF2	YGR129W	YIL163C	P40448	117 aa		3.6	□□□□□ -1.83

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