RNA–Protein interactions for RNA: YFL018C

LPD1, Transcript of Dihydrolipoamide dehydrogenase, yeastyeast

Gene LPD1, Length 1,500 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LPD1YFL018C YHM2Q04013 314 aa6.6□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C HPF1Q05164 967 aa6.6□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C XYL2Q07993 356 aa6.6□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C YOL029CQ08187 201 aa6.6□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C YOR186WQ08560 144 aa6.6□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C YPR064WQ12492 139 aa6.6□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C YMR316C-AI2HB70 103 aa6.6□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C YMR31P19955 123 aa6.6□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C DSS4P32601 143 aa6.6□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C ERF2Q06551 359 aa6.6□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C MIM1Q08176 113 aa6.6□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C YPS3Q12303 508 aa6.6□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C NRG2P38082 220 aa6.59□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C GLE2P40066 365 aa6.59□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C SKI6P46948 246 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C YDR042CQ03205 200 aa6.59□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C SDC1Q03323 175 aa6.59□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C HNT3Q08702 217 aa6.59□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C USV1Q12132 391 aa6.59□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C YLR365WQ7LIF2 110 aa6.59□□□□□ -1.35
LPD1YFL018C TRP1P00912 224 aa6.58□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C YHR140WP38842 239 aa6.58□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C YPI1P43587 155 aa6.58□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C GPI19Q04082 140 aa6.58□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C MET32Q12041 191 aa6.58□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C MDM10P18409 493 aa6.57□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C SVP26P38869 228 aa6.57□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C LSM6Q06406 86 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C YLR012CQ07927 99 aa6.57□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C TIM18Q08749 192 aa6.57□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C YCR006CP25350 157 aa6.56□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C ATP19P81451 68 aa6.56□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C PET191Q02772 108 aa6.56□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C IRC25Q07951 179 aa6.56□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C YPL038W-AQ3E7B4 63 aa6.56□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C HUG1Q6Q5K6 68 aa6.56□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C YHR139C-AO13536 103 aa6.55□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C SFT2P38166 215 aa6.55□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C CSH1P38287 376 aa6.55□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C CIS3P47001 227 aa6.55□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C YBR255C-AQ3E776 120 aa6.55□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C YLR302CO13544 120 aa6.55□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C FZF1P32805 299 aa6.55□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C SMP1P38128 452 aa6.55□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C VPS55P47111 140 aa6.55□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C YGR164WP53291 111 aa6.55□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C YMR321CQ04898 105 aa6.55□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C SUT2Q12286 268 aa6.55□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C YPR108W-AQ3E7B3 70 aa6.55□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C RFA2P26754 273 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C GPI18P38211 433 aa6.54□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C SFT1P43682 97 aa6.54□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C FIP1P45976 327 aa6.54□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C Q0255P03881 472 aa6.53□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C PIS1P06197 220 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C RPS2P25443 254 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C IMP1P28627 190 aa6.53□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C FMP46P36141 133 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C LST8P41318 303 aa6.53□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C YGR050CP53231 118 aa6.53□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa6.53□□□□□ -1.36
LPD1YFL018C PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C TOM40P23644 387 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C MLF3P32047 452 aa6.52□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C YGR219WP53307 113 aa6.52□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C CUZ1P53899 274 aa6.52□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C KSH1Q8TGJ3 72 aa6.52□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C RPB8P20436 146 aa6.51□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C REC104P33323 182 aa6.51□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C PAU7P39545 55 aa6.51□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C MMS2P53152 137 aa6.51□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C RLM1Q12224 676 aa6.5□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C Q0182Q9ZZW1 134 aa6.5□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C YHR173CP38864 112 aa6.5□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C MST27P53176 234 aa6.5□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C RXT3Q07458 294 aa6.5□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C YDR461C-AQ2V2P7 80 aa6.5□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C AQY1P0CD91 305 aa6.49□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C DSE2P38844 325 aa6.49□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C YMR317WQ04893 1140 aa6.49□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C SHH4Q06236 168 aa6.49□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C RRT13P40042 185 aa6.48□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C PIR1Q03178 341 aa6.48□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C ROX3P25046 220 aa6.47□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C YHR180WP38868 163 aa6.47□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data6.47□□□□□ -1.37not detected
LPD1YFL018C HSK3P69852 69 aa6.47□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C ROT1Q03691 256 aa6.47□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C YMR175W-AQ3E766 64 aa6.47□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C MRS3P10566 314 aa6.46□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C YAR029WP39549 74 aa6.46□□□□□ -1.37
LPD1YFL018C YEL067CP39978 195 aa6.46□□□□□ -1.37
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