RNA–Protein interactions for RNA: YER173W

RAD24, Transcript of Checkpoint protein, yeast

Gene RAD24, Length 1,980 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAD24	YER173W	COX18	P53239	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD24	YER173W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD24	YER173W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD24	YER173W	YKL102C	P34249	101 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD24	YER173W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD24	YER173W	PAU5	P43575	122 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD24	YER173W	DAD4	P69851	72 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD24	YER173W	RRG8	Q06109	277 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD24	YER173W	YOR105W	Q08504	108 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD24	YER173W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD24	YER173W	FZF1	P32805	299 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	AME1	P38313	324 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	YDL183C	P48569	320 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	GEP3	Q08622	556 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	TIR1	P10863	254 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	QRI5	P32344	111 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	DAD2	P36162	133 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	IZH3	Q07959	543 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	DAD1	Q12248	94 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	PRM7	Q12459	698 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	DYN1	P36022	4092 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	SIM1	P40472	476 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	YGL185C	P53100	379 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	CUP2	P15315	225 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	UTR5	P32630	166 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	GET2	P40056	285 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	YFR045W	P43617	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	TDA4	P47153	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	YIP3	P53633	176 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	GIM5	Q04493	163 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	TRI1	Q05024	226 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	PAU3	P25610	124 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	YBR144C	P34215	104 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	PAM17	P36147	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	MIX23	P38162	196 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	IRC22	P40006	225 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	ATP16	Q12165	160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	RPB11	P38902	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	CPT1	P17898	393 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	YHR022C	P38763	256 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	MPC2	P38857	129 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	YER135C	P40082	130 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	SPI1	P40092	148 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	MIC26	P50087	233 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	ALG13	P53178	202 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	MIG1	P27705	504 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	SUR2	P38992	349 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
RAD24	YER173W	CSM4	Q08955	156 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	CCW12	Q12127	133 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD24	YER173W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	ARL3	Q02804	198 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	MIG3	P39943	394 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	SDS23	P53172	527 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	UPS3	Q04006	179 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	TIM22	Q12328	207 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	PAU7	P39545	55 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	YGR149W	P48236	432 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	YGR017W	P53210	297 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	YDR274C	P87283	123 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	CYT2	Q00873	224 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	MDM10	P18409	493 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	COX16	P47081	118 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	VMA16	P23968	213 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	MRPL28	P36527	147 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	DIA1	P54005	336 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	VPS71	Q03433	280 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	GTO3	Q04806	366 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	POM33	Q12164	279 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	VAR1	P02381	398 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RAD24	YER173W	AGA1	P32323	725 aa		4.48	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 83.2 ms