RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W ECM29P38737 1868 aa4.29□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W MED6P38782 295 aa4.28□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W YMC1P32331 307 aa4.28□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W OM14P38325 134 aa4.28□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W BXI1P48558 297 aa4.28□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W MST27P53176 234 aa4.28□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W YNR064CP53750 290 aa4.28□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W YPL062WQ02781 134 aa4.28□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W ELP6Q04868 273 aa4.28□□□□□ -1.72
CYK3YDL117W UBC4P15731 148 aa4.28□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W FIP1P45976 327 aa4.28□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W COX12Q01519 83 aa4.28□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W RRS1Q08746 203 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W TIM18Q08749 192 aa4.28□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W AQY1P0CD91 305 aa4.27□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W ANS1P38832 159 aa4.27□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W GAT4P40569 121 aa4.27□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W EAF6P47128 113 aa4.27□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W YMR175W-AQ3E766 64 aa4.27□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W YPL038W-AQ3E7B4 63 aa4.27□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W UBR2Q07963 1872 aa4.27□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W QRI5P32344 111 aa4.27□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data4.27□□□□□ -1.73not detected
CYK3YDL117W SAP30P38429 201 aa4.27□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W TPC1P53257 314 aa4.27□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W LPP1Q04396 274 aa4.27□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W PBP4Q07362 185 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W YOR105WQ08504 108 aa4.27□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W AGA2P32781 87 aa4.26□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W YBR144CP34215 104 aa4.26□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W SFT2P38166 215 aa4.26□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W INM1P38710 295 aa4.26□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W MPD1Q12404 318 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W CSR2Q12734 1121 aa4.26□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W GSC2P40989 1895 aa4.26□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W YCR006CP25350 157 aa4.26□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W YPT10P38146 199 aa4.26□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W DFG10P40526 253 aa4.26□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W YIL029CP40538 142 aa4.26□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W Q0010Q9ZZX9 128 aa4.26□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W MDH2P22133 377 aa4.25□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W MRS4P23500 304 aa4.25□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W SPO13P23624 291 aa4.25□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W ECM15P35195 104 aa4.25□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W TDA4P47153 279 aa4.25□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W SLG1P54867 378 aa4.25□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W AYT1Q12226 474 aa4.25□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W BET1P22804 142 aa4.25□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W CSH1P38287 376 aa4.25□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W RRT13P40042 185 aa4.25□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W YGL118CP53132 145 aa4.25□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W YNL234WP53857 426 aa4.25□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W SWT21P53873 357 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W SYM1Q06563 197 aa4.25□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W YNL046WP53956 172 aa4.24□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W YDL242WQ07746 117 aa4.24□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W RFA2P26754 273 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W YBL059WP34224 193 aa4.24□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W TOS8P53147 276 aa4.24□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W PET191Q02772 108 aa4.24□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W MIX17Q03667 156 aa4.24□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W YHR139C-AO13536 103 aa4.23□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W FZF1P32805 299 aa4.23□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W SKI6P46948 246 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W VPS55P47111 140 aa4.23□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W EMC6Q12431 108 aa4.23□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W RRT15Q3E811 62 aa4.23□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W MXR2P25566 168 aa4.23□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W YNL195CP40168 261 aa4.23□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W PIR3Q03180 325 aa4.23□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W NIP7Q08962 181 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W RNH203Q12338 110 aa4.23□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W NPC2Q12408 173 aa4.23□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W MIC10Q96VH5 97 aa4.23□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W SOD1P00445 154 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W RPP1P38786 293 aa4.22□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W GGC1P38988 300 aa4.22□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W YER181CP40097 107 aa4.22□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W PEX17P40155 199 aa4.22□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W CIS3P47001 227 aa4.22□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W BOL2P53082 120 aa4.22□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W COX9P07255 59 aa4.22□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W SPT4P32914 102 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W HAL1Q01766 294 aa4.22□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W SUT2Q12286 268 aa4.22□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W PIR5P46999 287 aa4.21□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W RSM19P53733 91 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W CUZ1P53899 274 aa4.21□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W MCH4Q08268 501 aa4.21□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W YDR381C-AQ3E6R5 114 aa4.21□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W YOR376W-AQ3E805 51 aa4.21□□□□□ -1.73
CYK3YDL117W YNL200CP40165 246 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
CYK3YDL117W YIL014C-AQ02598 104 aa4.21□□□□□ -1.74
CYK3YDL117W YBR255C-AQ3E776 120 aa4.21□□□□□ -1.74
CYK3YDL117W LAA1P39526 2014 aa4.2□□□□□ -1.74
CYK3YDL117W PMD1P32634 1753 aa4.2□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 31.3 ms