RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YNR071C	P53757	342 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	HPA2	Q06592	156 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	HRT1	Q08273	121 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YDL180W	Q12301	547 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	STE18	P18852	110 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	FUB1	P25659	250 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	MST28	P39552	234 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	MRPL19	P53875	158 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	OPI3	P05375	206 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	PHO85	P17157	305 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YFR020W	P43600	232 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	TPC1	P53257	314 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	WSC2	P53832	503 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	USV1	Q12132	391 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	ENV10	Q99382	181 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YKL044W	P36092	106 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	SDS23	P53172	527 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	NCE103	P53615	221 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	RAV2	Q03956	351 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YFH1	Q07540	174 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	TOM1	Q03280	3268 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	CDC26	P14724	124 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YCR085W	P25650	117 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	REC114	P32841	428 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.02	□□□□□ -1.77	not detected
CLF1	YLR117C	GCS1	P35197	352 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	SRX1	P36077	127 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YKR041W	P36134	250 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YFR045W	P43617	309 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	PET191	Q02772	108 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	ATG33	Q06485	197 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	ECM12	O13529	151 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	BET2	P20133	325 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	MID2	P36027	376 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	FRM2	P37261	193 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	CUP9	P41817	306 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	UBC11	P52492	156 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	GEP7	P53171	287 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YDR029W	Q12111	104 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YDR215C	Q12240	137 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YSR3	P23501	404 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YER181C	P40097	107 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	SBH1	P52870	82 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	ALG13	P53178	202 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	PIR1	Q03178	341 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	MSA1	Q08471	629 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	FCY1	Q12178	158 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	ABF2	Q02486	183 aa		4	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YOL029C	Q08187	201 aa		4	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	FIT3	Q08907	204 aa		4	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	RFM1	Q12192	310 aa		4	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YKL070W	P36087	169 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	LTP1	P40347	161 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	LCB3	P47013	409 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	DSK2	P48510	373 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	KNH1	P50112	268 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	CAX4	P53223	239 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	HPF1	Q05164	967 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	MCH4	Q08268	501 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YOR292C	Q08743	309 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	INO2	P26798	304 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	APS1	P35181	156 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YPL073C	P40323	161 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	CUZ1	P53899	274 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	MRX11	Q03079	207 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YOR387C	Q08910	206 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YPI1	P43587	155 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YGR050C	P53231	118 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	AQR1	P53943	586 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	AIM11	P87275	137 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	UPS1	Q05776	175 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	TIM18	Q08749	192 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	YLR302C	O13544	120 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	SPC29	P33419	253 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLF1	YLR117C	MRPS5	P33759	307 aa		3.98	□□□□□ -1.77

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