RNA–Protein interactions for RNA: YLL059C

YLL059C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YLL059C, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL059C	YLL059C	UTR5	P32630	166 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YLL059C	YLL059C	VMA7	P39111	118 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YLL059C	YLL059C	SPC25	P40014	221 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YLL059C	YLL059C	POR2	P40478	281 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YLL059C	YLL059C	EMC5	P40540	141 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YLL059C	YLL059C	RPA43	P46669	326 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YLL059C	YLL059C	CPD1	P53314	239 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YLL059C	YLL059C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.28	□□□□□ -1.72
YLL059C	YLL059C	YHP1	Q04116	353 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YLL059C	YLL059C	TIM18	Q08749	192 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YLL059C	YLL059C	CYC3	P06182	269 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	CDC7	P06243	507 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	ZRC1	P20107	442 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	YBL059W	P34224	193 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	YPI1	P43587	155 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	LST7	P53237	242 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	HST4	P53688	370 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	SHH3	Q04487	196 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	LDS2	Q08218	356 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	IRC23	Q08416	157 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	FMP16	Q12497	93 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	COX19	Q3E731	98 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	SPO13	P23624	291 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	DER1	P38307	211 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	DXO1	Q06349	442 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	CTR3	Q06686	241 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	COX2	P00410	251 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	CDC50	P25656	391 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	SFT2	P38166	215 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	MST28	P39552	234 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	IMP2	P46972	177 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	CGR1	P53188	120 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	YMR007W	Q03675	126 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	ATC1	Q04005	294 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	AVO2	Q04749	426 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	AGE2	P40529	298 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	OCA2	P53949	197 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	ADD37	Q03233	198 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	TMA23	Q03525	211 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	YOR015W	Q12169	119 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	MSK1	P32048	576 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	MIX23	P38162	196 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	SNF11	P38956	169 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	PAU4	P53427	120 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	YMR181C	Q03231	154 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	ATG39	Q06159	398 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	ATP14	Q12349	124 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	LDS1	P31379	325 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	MPC2	P38857	129 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	SNN1	P48232	102 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	UBC7	Q02159	165 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	MRX11	Q03079	207 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	RRG8	Q06109	277 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL059C	YLL059C	PAU1	P0CE88	120 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	PAU14	P0CE89	120 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	PAU6	P0CE90	120 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	PAU18	P0CE91	120 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	PAU8	P0CE92	120 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	PAU11	P0CE93	120 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	DDI2	P0CH63	225 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	DDI3	P0CH64	225 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	MIG1	P27705	504 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	SRB6	P32570	121 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	PAU13	P38725	120 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	GLE2	P40066	365 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	DSK2	P48510	373 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	PAU10	Q03050	120 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	PAU20	Q08322	120 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	PAU9	Q3E770	120 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	SDH4	P37298	181 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	RIB5	P38145	238 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	AIM24	P47127	394 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	CAX4	P53223	239 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	FIT2	Q08906	153 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	YPL162C	Q12042	273 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	MRS1	P07266	363 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL059C	YLL059C	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 71.7 ms