RNA–Protein interactions for RNA: YJL135W

YJL135W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL135W, Length 318 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL135W	YJL135W	YJL009W	P47078	108 aa		0.12	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	RCF2	P53721	224 aa		0.12	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	GRX3	Q03835	250 aa		0.12	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	UBR1	P19812	1950 aa		0.12	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	YGL101W	P53144	215 aa		0.11	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	SEN15	Q04675	128 aa		0.11	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	IRC21	Q04772	201 aa		0.11	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	RIB3	Q99258	208 aa		0.11	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	YLR157W-E	P0CF00	54 aa		0.1	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	MRS4	P23500	304 aa		0.1	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	YHR140W	P38842	239 aa		0.1	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	YGL193C	P53097	103 aa		0.1	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	ORM1	P53224	222 aa		0.1	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	IRC19	Q07843	230 aa		0.1	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	SRL3	P36167	246 aa		0.09	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	FES1	P38260	290 aa		0.09	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	DLS1	P40366	167 aa		0.09	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	ATP19	P81451	68 aa		0.09	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	YDR476C	Q03362	224 aa		0.09	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	MAK3	Q03503	176 aa		0.09	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	YPR153W	Q06537	140 aa		0.09	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	GPI11	Q06636	219 aa		0.09	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	RFU1	Q08003	200 aa		0.09	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	SRP21	P32342	167 aa		0.08	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		0.08	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	COA6	Q3E846	104 aa		0.08	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	PEX34	P25584	144 aa		0.07	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	MVB12	P42939	101 aa		0.07	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	GPI2	P46961	280 aa		0.07	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	DIE2	P50076	525 aa		0.07	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	EST3	Q03096	181 aa		0.07	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	YPD1	Q07688	167 aa		0.07	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	RRT7	Q07829	113 aa		0.07	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	YLR053C	Q12026	108 aa		0.07	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	RDI1	Q12434	202 aa		0.07	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	BNI1	P41832	1953 aa		0.06	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		0.06	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	VPS51	P36116	164 aa		0.06	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	APQ12	P40532	138 aa		0.06	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	FIP1	P45976	327 aa		0.06	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	GIM5	Q04493	163 aa		0.06	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	YPR202W	Q08993	238 aa		0.06	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	MHF1	Q3E835	90 aa		0.06	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	YER121W	P40076	114 aa		0.05	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	0.05	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	YMR122C	Q03879	124 aa		0.05	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	YMR321C	Q04898	105 aa		0.05	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	FIT3	Q08907	204 aa		0.05	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	HUT1	Q12520	339 aa		0.05	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	SCS22	Q6Q595	175 aa		0.05	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		0.05	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	PHO13	P19881	312 aa		0.04	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	YER181C	P40097	107 aa		0.04	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	KTI11	Q3E840	82 aa		0.04	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	COX5B	P00425	151 aa		0.03	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	0.03	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	0.03	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	SLM6	P38343	150 aa		0.03	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	0.03	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	0.03	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	LST8	P41318	303 aa		0.03	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	YNL019C	P53975	284 aa		0.03	□□□□□ -2.4
YJL135W	YJL135W	GSC2	P40989	1895 aa		0.02	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	QCR2	P07257	368 aa		0.02	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	ANB1	P19211	157 aa		0.02	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	0.02	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	COA4	Q05809	96 aa		0.02	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	NMT1	P14743	455 aa		0.01	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	FUN14	P18411	198 aa		0.01	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	FYV5	P25585	152 aa		0.01	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		0.01	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	0.01	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	YHR213W	P0CI67	198 aa		0	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	0	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	0	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	TY4B-J	P47024	1803 aa		0	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	EMC4	P53073	190 aa		0	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	YCL001W-A	P87012	153 aa		0	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	0	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	CHD1	P32657	1468 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	SAC3	P46674	1301 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	YBR013C	P38215	129 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	AME1	P38313	324 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	MIC27	P50945	234 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	RAF1	Q06891	181 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	NAT5	Q08689	176 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	-0.02	□□□□□ -2.41
YJL135W	YJL135W	PHB1	P40961	287 aa		-0.02	□□□□□ -2.41

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