RNA–Protein interactions for RNA: YJL134W

LCB3, Transcript of Long-chain base-1-phosphate phosphatase, yeastyeast

Gene LCB3, Length 1,230 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB3YJL134W ERG27Q12452 347 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
LCB3YJL134W PHD1P36093 366 aa5.09□□□□□ -1.59
LCB3YJL134W IRC22P40006 225 aa5.09□□□□□ -1.59
LCB3YJL134W YJL163CP46996 555 aa5.09□□□□□ -1.59
LCB3YJL134W CGR1P53188 120 aa5.09□□□□□ -1.59
LCB3YJL134W YGR018CP53211 109 aa5.09□□□□□ -1.59
LCB3YJL134W YNL234WP53857 426 aa5.09□□□□□ -1.59
LCB3YJL134W SDH7Q04401 133 aa5.09□□□□□ -1.59
LCB3YJL134W ADH6Q04894 360 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
LCB3YJL134W MCH1Q07376 486 aa5.09□□□□□ -1.59
LCB3YJL134W IZH3Q07959 543 aa5.09□□□□□ -1.59
LCB3YJL134W LAS17Q12446 633 aa5.09□□□□□ -1.59
LCB3YJL134W YBR126W-AQ8TGU7 68 aa5.09□□□□□ -1.59
LCB3YJL134W PHO85P17157 305 aa5.08□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W YCR022CP25620 114 aa5.08□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W SUA7P29055 345 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W YKL075CP36083 450 aa5.08□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W AVT5P38176 459 aa5.08□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W RRT1P38192 103 aa5.08□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W ICS2P38284 255 aa5.08□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W CSH1P38287 376 aa5.08□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W DOG2P38773 246 aa5.08□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W DOG1P38774 246 aa5.08□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W RKI1Q12189 258 aa5.08□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W GEP5Q12393 293 aa5.08□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W SPO24Q3E752 67 aa5.08□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W SRP21P32342 167 aa5.07□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W YKR045CP36138 183 aa5.07□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W DAD2P36162 133 aa5.07□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W SFT2P38166 215 aa5.07□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W YHR173CP38864 112 aa5.07□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W YIL012WP40551 113 aa5.07□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W TMA10Q06177 86 aa5.07□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W YOR105WQ08504 108 aa5.07□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W FIT2Q08906 153 aa5.07□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W YPR063CQ12160 140 aa5.07□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W FCY1Q12178 158 aa5.07□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W RDL1Q12305 139 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W MRPL28P36527 147 aa5.06□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W LSM2P38203 95 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W SRP14P38985 146 aa5.06□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W YIR020CP40575 100 aa5.06□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W YJL213WP40896 331 aa5.06□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W HST4P53688 370 aa5.06□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W RAV2Q03956 351 aa5.06□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W LSM8P47093 109 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W YGR149WP48236 432 aa5.05□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W OCA2P53949 197 aa5.05□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W ATP19P81451 68 aa5.05□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W MRX11Q03079 207 aa5.05□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W AYT1Q12226 474 aa5.05□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W YNR034W-AQ3E841 98 aa5.05□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W YCL001W-BQ96VH2 84 aa5.05□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W COX2P00410 251 aa5.04□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W CYT2Q00873 224 aa5.04□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W MRS1P07266 363 aa5.03□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W YPS1P32329 569 aa5.03□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W VMA11P32842 164 aa5.03□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W LSM4P40070 187 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W ABM1P47146 123 aa5.03□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W CPD1P53314 239 aa5.03□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W TOM7P53507 60 aa5.03□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W SEN15Q04675 128 aa5.03□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W Q0297Q9ZZV8 51 aa5.03□□□□□ -1.6
LCB3YJL134W POR1P04840 283 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W HMRA1P0CY11 126 aa5.02□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W TIR1P10863 254 aa5.02□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W CUP2P15315 225 aa5.02□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W QRI5P32344 111 aa5.02□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W TIR2P33890 251 aa5.02□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W ELF1P36053 145 aa5.02□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W PAM17P36147 197 aa5.02□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W YBR090CP38253 122 aa5.02□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W RPB11P38902 120 aa5.02□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W GIM5Q04493 163 aa5.02□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W PBP4Q07362 185 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W IRC23Q08416 157 aa5.02□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W ATX2Q12067 313 aa5.02□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W COA6Q3E846 104 aa5.02□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W YER175W-AQ8TGU4 54 aa5.02□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W YHR213WP0CI67 198 aa5.01□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W YPT10P38146 199 aa5.01□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W HUA1P40325 198 aa5.01□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W WWM1P43582 211 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W SWT21P53873 357 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W DDI2P0CH63 225 aa5□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W DDI3P0CH64 225 aa5□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W MIX23P38162 196 aa5□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W SNU13P39990 126 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W IMP2P46972 177 aa5□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W YMR166CQ03829 368 aa5□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W TIM18Q08749 192 aa5□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W YIL134C-AQ45U18 67 aa5□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W BPH1P25356 2167 aa4.99□□□□□ -1.61
LCB3YJL134W HTB2P02294 131 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.5 ms