RNA–Protein interactions for RNA: YGR108W

CLB1, Transcript of B-type cyclin involved in cell cycle progression, yeast

Gene CLB1, Length 1,416 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLB1	YGR108W	YNL198C	P40166	100 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YIL029C	P40538	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	SAS2	P40963	338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	PGU1	P47180	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YGL118C	P53132	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	SUN4	P53616	420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	POS5	Q06892	414 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	SLO1	Q3E784	85 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	VPS13	Q07878	3144 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	BET2	P20133	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YCR006C	P25350	157 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YHL044W	P38727	235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	BRP1	P53194	125 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YNR064C	P53750	290 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	RAF1	Q06891	181 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YPS3	Q12303	508 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	MRS1	P07266	363 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	ANB1	P19211	157 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	FZF1	P32805	299 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	HSK3	P69852	69 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	SDC1	Q03323	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	RAV2	Q03956	351 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	DPP1	Q05521	289 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YHR173C	P38864	112 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	YGR017W	P53210	297 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	CAB4	P53332	305 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	TOM7	P53507	60 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	VPS71	Q03433	280 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	UPS1	Q05776	175 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	VPS63	O13549	108 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	UBC13	P52490	153 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	ATG21	Q02887	496 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	BET5	Q03630	159 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	MIX14	Q04341	121 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	TIR1	P10863	254 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	YMR31	P19955	123 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	YAR068W	P39564	161 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	YIL012W	P40551	113 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	ABM1	P47146	123 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	ATP19	P81451	68 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	FIT2	Q08906	153 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	MRPS5	P33759	307 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	YPT53	P36019	220 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	LTP1	P40347	161 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	CRZ1	P53968	678 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	IRC25	Q07951	179 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	TIM18	Q08749	192 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	CDC43	P18898	376 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	SFT2	P38166	215 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	YBR220C	P38318	560 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	YPS6	P40583	537 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	EGT2	P42835	1041 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	YFR045W	P43617	309 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	YDR114C	Q04597	100 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	SCW10	Q04951	389 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	RFM1	Q12192	310 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	YOS1	Q3E834	85 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	YPS1	P32329	569 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	DIA1	P54005	336 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	YML079W	Q03629	201 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	AYT1	Q12226	474 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	MDM10	P18409	493 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CLB1	YGR108W	MTC6	P38849	526 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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