RNA–Protein interactions for RNA: YBR286W

APE3, Transcript of Vacuolar aminopeptidase Y, yeast

Gene APE3, Length 1,614 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APE3	YBR286W	NAT3	Q06504	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APE3	YBR286W	ATP16	Q12165	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APE3	YBR286W	YLR302C	O13544	120 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APE3	YBR286W	YCL042W	P25572	119 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APE3	YBR286W	INO2	P26798	304 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APE3	YBR286W	GET2	P40056	285 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APE3	YBR286W	CYB5	P40312	120 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APE3	YBR286W	YGR219W	P53307	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APE3	YBR286W	TOM7	P53507	60 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APE3	YBR286W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APE3	YBR286W	SDH7	Q04401	133 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APE3	YBR286W	SRL1	Q08673	210 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APE3	YBR286W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	SRP21	P32342	167 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	ICS2	P38284	255 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	YHR173C	P38864	112 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	CPD1	P53314	239 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	TIM18	Q08749	192 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	YOP1	Q12402	180 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	CYC3	P06182	269 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	HSP10	P38910	106 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	MRX11	Q03079	207 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	LAS17	Q12446	633 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	YGL010W	P25338	174 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	YCR041W	P37265	110 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	PAU5	P43575	122 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	MRS1	P07266	363 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	DDI2	P0CH63	225 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	DDI3	P0CH64	225 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	TIR2	P33890	251 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	MIC12	P38341	106 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	YER188W	P40103	239 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	YIL077C	P40508	320 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	VPS55	P47111	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	AIM24	P47127	394 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	CGR1	P53188	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	SPG4	Q04438	115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	ATX2	Q12067	313 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	DCN1	Q12395	269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	DYN1	P36022	4092 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	CCW14	O13547	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	YGR025W	P53216	100 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	ATP19	P81451	68 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	APS2	Q00381	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	YPR013C	Q12145	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	PAU3	P25610	124 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	FZF1	P32805	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	MBB1	P39534	108 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	YMR141C	P40211	102 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	POR2	P40478	281 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	LCB3	P47013	409 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	TOS8	P53147	276 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	CAB4	P53332	305 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	HOR7	Q05827	59 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	COX2	P00410	251 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	QRI5	P32344	111 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	YKL075C	P36083	450 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	PAM17	P36147	197 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	DAD2	P36162	133 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	FIP1	P45976	327 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	YGL185C	P53100	379 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	COX18	P53239	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	YOR105W	Q08504	108 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	HTB2	P02294	131 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	TIR1	P10863	254 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	CUP2	P15315	225 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APE3	YBR286W	ERS1	P17261	260 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APE3	YBR286W	YPT10	P38146	199 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APE3	YBR286W	MIX23	P38162	196 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APE3	YBR286W	YNL194C	P40169	301 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APE3	YBR286W	YDL183C	P48569	320 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APE3	YBR286W	NCE103	P53615	221 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APE3	YBR286W	UBC7	Q02159	165 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APE3	YBR286W	ARL3	Q02804	198 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APE3	YBR286W	IZH1	Q03419	316 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APE3	YBR286W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
APE3	YBR286W	SDH8	P38345	138 aa		4.51	□□□□□ -1.69
APE3	YBR286W	SUR2	P38992	349 aa		4.51	□□□□□ -1.69
APE3	YBR286W	YPI1	P43587	155 aa		4.51	□□□□□ -1.69
APE3	YBR286W	CAX4	P53223	239 aa		4.51	□□□□□ -1.69
APE3	YBR286W	DUG3	P53871	357 aa		4.51	□□□□□ -1.69
APE3	YBR286W	DAD4	P69851	72 aa		4.51	□□□□□ -1.69
APE3	YBR286W	DXO1	Q06349	442 aa		4.51	□□□□□ -1.69
APE3	YBR286W	AME1	P38313	324 aa		4.5	□□□□□ -1.69
APE3	YBR286W	SNF11	P38956	169 aa		4.5	□□□□□ -1.69
APE3	YBR286W	MST28	P39552	234 aa		4.5	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.5 ms