RNA–Protein interactions for RNA: YBR228W

SLX1, Transcript of Endonuclease involved in DNA recombination and repair, yeast

Gene SLX1, Length 915 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX1	YBR228W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	YHP1	Q04116	353 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	RAD28	Q12021	506 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	YOR015W	Q12169	119 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	COX19	Q3E731	98 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	SPO13	P23624	291 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	CDC50	P25656	391 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	YBL071C	P38185	102 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	SHG1	P38337	142 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	YAR068W	P39564	161 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	SPC25	P40014	221 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	YMR007W	Q03675	126 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	CTR3	Q06686	241 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	IRC23	Q08416	157 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	QCR9	P22289	66 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	INO2	P26798	304 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	MSK1	P32048	576 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	YPS1	P32329	569 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	FPR2	P32472	135 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	BDH1	P39714	382 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	MCM22	P47167	239 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	MIC27	P50945	234 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	YGR018C	P53211	109 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	OCA2	P53949	197 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	TMA23	Q03525	211 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	SHH3	Q04487	196 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	AVO2	Q04749	426 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	ATP16	Q12165	160 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	SRB6	P32570	121 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	CSH1	P38287	376 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	DER1	P38307	211 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	DOG2	P38773	246 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	DOG1	P38774	246 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	LST7	P53237	242 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	SPG4	Q04438	115 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	MSA1	Q08471	629 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	CDC7	P06243	507 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	LDS1	P31379	325 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	YKL075C	P36083	450 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	MRPS9	P38120	278 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	RRT1	P38192	103 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	AGE2	P40529	298 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	VPS55	P47111	140 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	YGR219W	P53307	113 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	PAU4	P53427	120 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	HOR7	Q05827	59 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SLX1	YBR228W	PAU1	P0CE88	120 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	PAU14	P0CE89	120 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	PAU6	P0CE90	120 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	PAU18	P0CE91	120 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	PAU8	P0CE92	120 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	PAU11	P0CE93	120 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	POP7	P38291	140 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	PAU13	P38725	120 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	DSK2	P48510	373 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	CPD1	P53314	239 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	HST4	P53688	370 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	PAU10	Q03050	120 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	ATC1	Q04005	294 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	SDH7	Q04401	133 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	PAU20	Q08322	120 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	PAU9	Q3E770	120 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	YHR213W	P0CI67	198 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	SFT2	P38166	215 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	TRS20	P38334	175 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	MIC12	P38341	106 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	OXA1	P39952	402 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	FIP1	P45976	327 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	TOS8	P53147	276 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	CGR1	P53188	120 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	CAB4	P53332	305 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	YMR253C	Q04835	414 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	DXO1	Q06349	442 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	CNB1	P25296	175 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	PRY2	P36110	329 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SLX1	YBR228W	GLE2	P40066	365 aa		3.13	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 71.1 ms