RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C YBR242WP38331 238 aa0.65□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C GLR1P41921 483 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C HSK3P69852 69 aa0.65□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C YPR203WQ08994 102 aa0.65□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C TRM3Q07527 1436 aa0.65□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C YEL073CP39974 107 aa0.65□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C YEL028WP39989 153 aa0.65□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C HHT1P61830 136 aa0.65□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C THI74Q04083 370 aa0.65□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C VPS51P36116 164 aa0.64□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C YHL037CP38733 133 aa0.64□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C MOB1P40484 314 aa0.64□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C PAC10P48363 199 aa0.64□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C FIT1Q04433 528 aa0.64□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C SYM1Q06563 197 aa0.64□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C HRD1Q08109 551 aa0.64□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C YER121WP40076 114 aa0.63□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C YFL051CP43552 160 aa0.63□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C RPL37BP51402 88 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C PTC1P35182 281 aa0.63□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C NQM1P53228 333 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C YML079WQ03629 201 aa0.63□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C AVO2Q04749 426 aa0.63□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C LCL2Q08045 131 aa0.63□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C YDL157CQ12082 118 aa0.63□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C CMC2Q3E7A4 109 aa0.63□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C RIF1P29539 1916 aa0.62□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C YGR269WP40326 108 aa0.62□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C YGL101WP53144 215 aa0.62□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C TMA20P89886 181 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C LIP1Q03579 150 aa0.62□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C SPS2P08459 502 aa0.61□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C RDI1Q12434 202 aa0.61□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C YER188C-AP0C0V2 99 aa0.61□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C SHB17P36136 271 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C UIP4Q08926 304 aa0.61□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C YLR046CQ12253 270 aa0.61□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C DCV1P43595 202 aa0.6□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C YGL230CP53074 147 aa0.6□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C ORM1P53224 222 aa0.6□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C YDL241WQ07738 123 aa0.6□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C ATG10Q07879 167 aa0.6□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C YLR053CQ12026 108 aa0.6□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C QCR2P07257 368 aa0.59□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C ATP5P09457 212 aa0.59□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C INO4P13902 151 aa0.59□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C PRE1P22141 198 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C UBC6P33296 250 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C YKR070WP36151 352 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C YAR064WP39563 99 aa0.59□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C CCC1P47818 322 aa0.59□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C YNR064CP53750 290 aa0.59□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C LSM3P57743 89 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C MAK3Q03503 176 aa0.59□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C AIM36Q03798 255 aa0.59□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C YPR114WQ06107 315 aa0.59□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C HFA1P32874 2273 aa0.59□□□□□ -2.31
HDA3YPR179C SRP102P36057 244 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C FES1P38260 290 aa0.59□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C YPT31P38555 223 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C TLG1Q03322 224 aa0.59□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C YDR476CQ03362 224 aa0.59□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C YDR102CQ03864 110 aa0.59□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C CCW12Q12127 133 aa0.59□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C RME1P32338 300 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C UGX2P32772 223 aa0.58□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C HTD2P38790 280 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C YIL102CP40488 101 aa0.58□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C YJR015WP47090 510 aa0.58□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C GEP7P53171 287 aa0.58□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C YPR202WQ08993 238 aa0.58□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C FCY1Q12178 158 aa0.58□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C SPA2P23201 1466 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C KIN28P06242 306 aa0.57□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C RPL30P14120 105 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C SPT14P32363 452 aa0.57□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C AME1P38313 324 aa0.57□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C CIN5P40917 295 aa0.57□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C YDC1Q02896 317 aa0.57□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C KEI1Q06346 221 aa0.57□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C TAF2P23255 1407 aa0.57□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C ADE6P38972 1358 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C SLM6P38343 150 aa0.57□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C DLS1P40366 167 aa0.57□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C YGL193CP53097 103 aa0.57□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C CMC4Q3E7A9 73 aa0.57□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C MRS4P23500 304 aa0.56□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C YEL014CP39999 101 aa0.56□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C APQ12P40532 138 aa0.56□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C FIP1P45976 327 aa0.56□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C APS3P47064 194 aa0.56□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C NSL1Q12143 216 aa0.56□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C CDC39P25655 2108 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C PEX34P25584 144 aa0.56□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C HSP150P32478 413 aa0.56□□□□□ -2.32
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