RNA–Protein interactions for RNA: YPR013C

CMR3, Transcript of Putative zinc finger protein, yeast

Gene CMR3, Length 954 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CMR3	YPR013C	DSE2	P38844	325 aa		2.8	□□□□□ -1.96
CMR3	YPR013C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
CMR3	YPR013C	GPI2	P46961	280 aa		2.8	□□□□□ -1.96
CMR3	YPR013C	DYN2	Q02647	92 aa		2.8	□□□□□ -1.96
CMR3	YPR013C	PIR1	Q03178	341 aa		2.8	□□□□□ -1.96
CMR3	YPR013C	RNH202	Q05635	350 aa		2.8	□□□□□ -1.96
CMR3	YPR013C	YOR015W	Q12169	119 aa		2.8	□□□□□ -1.96
CMR3	YPR013C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
CMR3	YPR013C	RIM9	Q04734	239 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CMR3	YPR013C	SML1	Q04964	104 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CMR3	YPR013C	YDR278C	Q05612	105 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CMR3	YPR013C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
CMR3	YPR013C	RFU1	Q08003	200 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CMR3	YPR013C	ATP14	Q12349	124 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CMR3	YPR013C	YLR422W	Q06409	1932 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CMR3	YPR013C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
CMR3	YPR013C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
CMR3	YPR013C	PAC10	P48363	199 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CMR3	YPR013C	YNR064C	P53750	290 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CMR3	YPR013C	DML1	Q03652	475 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CMR3	YPR013C	ANT1	Q06497	328 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CMR3	YPR013C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	MDH2	P22133	377 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	SRP21	P32342	167 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.77	□□□□□ -1.97	not detected
CMR3	YPR013C	DAN1	P47178	298 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	DAD4	P69851	72 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	FMN1	Q03778	218 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	UPS3	Q04006	179 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	ATG10	Q07879	167 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	GPA2	P10823	449 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	BUD25	P85052	153 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	RGM1	Q00453	211 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	ATG41	Q12048	136 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	RAD50	P12753	1312 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	AYR1	P40471	297 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	CIN5	P40917	295 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	EST3	Q03096	181 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	UPS1	Q05776	175 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	YPR114W	Q06107	315 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	RRT7	Q07829	113 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	UIP4	Q08926	304 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	SPC3	Q12133	184 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	MSB2	P32334	1306 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	COX8	P04039	78 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	YOL162W	P0CF19	215 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	NSE4	P43124	402 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	TIM8	P57744	87 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	YHP1	Q04116	353 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	FCY1	Q12178	158 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	BOL1	Q3E793	110 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	AHT1	P29589	182 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	MOB1	P40484	314 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	YML079W	Q03629	201 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	CNL1	Q06333	122 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	YHR007C-A	Q07074	71 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	MAK31	P23059	88 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	MRS4	P23500	304 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	PEP8	P40335	379 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	GLC8	P41818	229 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	GEP7	P53171	287 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.97
CMR3	YPR013C	MDM35	O60200	86 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	NRG2	P38082	220 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	YHR140W	P38842	239 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	APS3	P47064	194 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	YNL019C	P53975	284 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	NKP2	Q06162	153 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	FIT2	Q08906	153 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	SPS2	P08459	502 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	SEN2	P16658	377 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	YKR045C	P36138	183 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	SLO1	Q3E784	85 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	FLO9	P39712	1322 aa		2.69	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	UBR1	P19812	1950 aa		2.69	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		2.69	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	INO4	P13902	151 aa		2.69	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	YEL067C	P39978	195 aa		2.69	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	YGR269W	P40326	108 aa		2.69	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	YGR017W	P53210	297 aa		2.69	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	SPC24	Q04477	213 aa		2.69	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		2.69	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	STF2	P16965	84 aa		2.68	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	MPM1	P40364	252 aa		2.68	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	ATP19	P81451	68 aa		2.68	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	SDH7	Q04401	133 aa		2.68	□□□□□ -1.98
CMR3	YPR013C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		2.68	□□□□□ -1.98

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