RNA–Protein interactions for RNA: YNL247W

YNL247W, Transcript of Cysteinyl-tRNA synthetase, yeast

Gene YNL247W, Length 2,304 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL247W	YNL247W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.24	□□□□□ -1.73	not detected
YNL247W	YNL247W	YML122C	Q03207	126 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	ODC2	Q99297	307 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	ATP14	Q12349	124 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	ATO3	Q12359	275 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	YRF1-2	P40105	1681 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	AIF1	P52923	378 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	YDR366C	P87287	132 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	HAL1	Q01766	294 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	SLO1	Q3E784	85 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	SAS5	Q99314	248 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	NEJ1	Q06148	342 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	YER181C	P40097	107 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	YGR026W	P53217	278 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	VPS71	Q03433	280 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	YOR214C	Q12282	236 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL247W	YNL247W	YGR219W	P53307	113 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	HHO1	P53551	258 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	FYV12	Q08559	129 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	FKS3	Q04952	1785 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	YFL012W	P43580	148 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	YGR039W	P53225	103 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	SPT14	P32363	452 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	MID2	P36027	376 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	TRS20	P38334	175 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	TIM13	P53299	105 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	SLM2	P53955	656 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	SDH7	Q04401	133 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	TIR1	P10863	254 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	UTH1	P36135	365 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	CNL1	Q06333	122 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	TY4B-J	P47024	1803 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	GAL83	Q04739	417 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	PTC1	P35182	281 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	APS3	P47064	194 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	MRP49	P32388	137 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	YKR032W	P36127	104 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	YGL193C	P53097	103 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	UGX2	P32772	223 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	MSW1	P04803	379 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	HSP30	P25619	332 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	UMP1	P38293	148 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	YBR220C	P38318	560 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	PIR5	P46999	287 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	GPI2	P46961	280 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	MPC3	P53311	146 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	SRP21	P32342	167 aa		4.15	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.74	not detected
YNL247W	YNL247W	SBH1	P52870	82 aa		4.15	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	ATP20	Q12233	115 aa		4.15	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
YNL247W	YNL247W	YHL026C	P38740	315 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL247W	YNL247W	VMA7	P39111	118 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL247W	YNL247W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YNL247W	YNL247W	HPM1	P40481	377 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL247W	YNL247W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL247W	YNL247W	ARL3	Q02804	198 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL247W	YNL247W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL247W	YNL247W	SPC3	Q12133	184 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL247W	YNL247W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YNL247W	YNL247W	PGD1	P40356	397 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL247W	YNL247W	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL247W	YNL247W	PHO85	P17157	305 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL247W	YNL247W	PHO13	P19881	312 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL247W	YNL247W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YNL247W	YNL247W	EAF6	P47128	113 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL247W	YNL247W	FCY1	Q12178	158 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL247W	YNL247W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL247W	YNL247W	SPC25	P40014	221 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL247W	YNL247W	VPS28	Q02767	242 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL247W	YNL247W	HYM1	P32464	399 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL247W	YNL247W	SNC2	P33328	115 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL247W	YNL247W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.2 ms