RNA–Protein interactions for RNA: YMR294W

JNM1, Transcript of Component of the yeast dynactin complex, yeast

Gene JNM1, Length 1,122 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
JNM1	YMR294W	COA4	Q05809	96 aa		4.79	□□□□□ -1.64
JNM1	YMR294W	DCS1	Q06151	350 aa		4.79	□□□□□ -1.64
JNM1	YMR294W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.79	□□□□□ -1.64
JNM1	YMR294W	YKL102C	P34249	101 aa		4.78	□□□□□ -1.64
JNM1	YMR294W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
JNM1	YMR294W	YAR068W	P39564	161 aa		4.78	□□□□□ -1.64
JNM1	YMR294W	YGR269W	P40326	108 aa		4.78	□□□□□ -1.64
JNM1	YMR294W	ATG27	P46989	271 aa		4.78	□□□□□ -1.64
JNM1	YMR294W	ECM27	P47144	725 aa		4.78	□□□□□ -1.64
JNM1	YMR294W	MRPL50	P53724	139 aa		4.78	□□□□□ -1.64
JNM1	YMR294W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.78	□□□□□ -1.64
JNM1	YMR294W	YPS3	Q12303	508 aa		4.78	□□□□□ -1.64
JNM1	YMR294W	PRR2	Q12310	699 aa		4.78	□□□□□ -1.64
JNM1	YMR294W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	ELO2	P25358	347 aa		4.77	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	UPS2	P35200	230 aa		4.77	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	YEA4	P40004	342 aa		4.77	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	SRB7	P47822	140 aa		4.77	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	YDL186W	P48568	277 aa		4.77	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.77	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	PRY2	P36110	329 aa		4.76	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	QDR3	P38227	689 aa		4.76	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	HXT14	P42833	540 aa		4.76	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	YJR015W	P47090	510 aa		4.76	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	HOR7	Q05827	59 aa		4.76	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	AGC1	Q12482	902 aa		4.76	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.75	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	YCR022C	P25620	114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	SYG1	P40528	902 aa		4.75	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	YGR018C	P53211	109 aa		4.75	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	YGR219W	P53307	113 aa		4.75	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	CDC50	P25656	391 aa		4.74	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	DOG2	P38773	246 aa		4.74	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	DOG1	P38774	246 aa		4.74	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	BDH1	P39714	382 aa		4.74	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	SWM2	P40342	146 aa		4.74	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	RPA43	P46669	326 aa		4.74	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	TOS8	P53147	276 aa		4.74	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	LST7	P53237	242 aa		4.74	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	RAD28	Q12021	506 aa		4.74	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		4.74	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	YBL071C	P38185	102 aa		4.73	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	CSH1	P38287	376 aa		4.73	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	CPD1	P53314	239 aa		4.73	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	ADD37	Q03233	198 aa		4.73	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	FMP16	Q12497	93 aa		4.73	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.72	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		4.72	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	SPO13	P23624	291 aa		4.72	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	AHT1	P29589	182 aa		4.72	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	YBL059W	P34224	193 aa		4.72	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	GLE2	P40066	365 aa		4.72	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	ERG25	P53045	309 aa		4.72	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	BOR1	P53838	576 aa		4.72	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	YMR007W	Q03675	126 aa		4.72	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	SHH3	Q04487	196 aa		4.72	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	CTR3	Q06686	241 aa		4.72	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	YPR013C	Q12145	317 aa		4.72	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.72	□□□□□ -1.65
JNM1	YMR294W	CYC3	P06182	269 aa		4.71	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.71	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	FPR2	P32472	135 aa		4.71	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	YKL075C	P36083	450 aa		4.71	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	AVT5	P38176	459 aa		4.71	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	RRT1	P38192	103 aa		4.71	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	MIC12	P38341	106 aa		4.71	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	CAB4	P53332	305 aa		4.71	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	YNR066C	P53752	436 aa		4.71	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	AVO2	Q04749	426 aa		4.71	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	YCR007C	P25354	239 aa		4.7	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	POP5	P28005	173 aa		4.7	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	EMC5	P40540	141 aa		4.7	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	MIC27	P50945	234 aa		4.7	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	ORM1	P53224	222 aa		4.7	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	VPS71	Q03433	280 aa		4.7	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	CDC7	P06243	507 aa		4.69	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	CMC1	P36064	111 aa		4.69	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	DER1	P38307	211 aa		4.69	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	CAX4	P53223	239 aa		4.69	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.69	□□□□□ -1.66
JNM1	YMR294W	ODC1	Q03028	310 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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