RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W AIM24P47127 394 aa6.51□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W LSM7P53905 115 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W ODC1Q03028 310 aa6.51□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W IZH1Q03419 316 aa6.51□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W POM34Q12445 299 aa6.51□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W FPR2P32472 135 aa6.5□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W IPI1P38803 334 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W YIL077CP40508 320 aa6.5□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W CWC23P52868 283 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W SPO19Q03029 223 aa6.5□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W LOA1Q06508 300 aa6.5□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W LCL2Q08045 131 aa6.5□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W NGL1Q08213 363 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W VMA16P23968 213 aa6.49□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W YCR025CP25352 136 aa6.49□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W SHB17P36136 271 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W YIF1P53845 314 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W FMP41P53889 259 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W ANB1P19211 157 aa6.48□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W SUA5P32579 426 aa6.48□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W LSM2P38203 95 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W YNL200CP40165 246 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W PRE5P40302 234 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W RAI1P53063 387 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W PDR17P53844 350 aa6.48□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W YPR063CQ12160 140 aa6.48□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W TRM13Q12383 476 aa6.48□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W SFT2P38166 215 aa6.47□□□□□ -1.37
YLR349WYLR349W TIR2P33890 251 aa6.46□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W IES5P40060 125 aa6.46□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W YOL085CQ99345 113 aa6.46□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W MRP10O75012 95 aa6.45□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W PHO92Q06390 306 aa6.45□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data6.45□□□□□ -1.38not detected
YLR349WYLR349W YPR053CQ6Q5F3 151 aa6.45□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W SPT14P32363 452 aa6.44□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W VHS2P40463 436 aa6.44□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W TPN1P53099 579 aa6.44□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W ORM1P53224 222 aa6.44□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W ERV2Q12284 196 aa6.44□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W SCM3Q12334 223 aa6.44□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W CUP2P15315 225 aa6.43□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W MRPL3P36516 390 aa6.43□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W YHR022CP38763 256 aa6.43□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W PTC7P38797 343 aa6.43□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W MIC27P50945 234 aa6.43□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W SHH3Q04487 196 aa6.43□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W ARR3Q06598 404 aa6.43□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W RRT7Q07829 113 aa6.43□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W MRP2P10663 115 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W YGR269WP40326 108 aa6.42□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W GPG1P53130 126 aa6.42□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W CCW12Q12127 133 aa6.42□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W YCR075W-AQ3E830 75 aa6.42□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W RPN13O13563 156 aa6.41□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W MRPL4P36517 319 aa6.41□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W PET100P38958 111 aa6.41□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W SPS2P08459 502 aa6.4□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W NHP6BP11633 99 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W TIP1P27654 210 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W IRC22P40006 225 aa6.4□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W YNR071CP53757 342 aa6.4□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W BOR1P53838 576 aa6.4□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W GPI15P53961 229 aa6.4□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W CTR3Q06686 241 aa6.4□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W CRC1Q12289 327 aa6.4□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W TMA17Q12513 150 aa6.4□□□□□ -1.38
YLR349WYLR349W SLM6P38343 150 aa6.39□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W SWM2P40342 146 aa6.39□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W PKP2P53170 491 aa6.39□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W TOM7P53507 60 aa6.39□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W MBB1P39534 108 aa6.38□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W ENV7Q12003 364 aa6.38□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W RPL13BP40212 199 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W YPS5P53057 165 aa6.37□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W YPR145C-AQ2V2P0 78 aa6.37□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W ARG80P07249 177 aa6.36□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W PUT1P09368 476 aa6.36□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W DDI2P0CH63 225 aa6.36□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W DDI3P0CH64 225 aa6.36□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W GCN3P14741 305 aa6.36□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W YEA6P39953 335 aa6.36□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W YMR082CQ04276 118 aa6.36□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W PRR2Q12310 699 aa6.36□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W YLR146W-AQ2V2P1 62 aa6.36□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W YHR213W-AQ8TGT4 77 aa6.36□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W RPB3P16370 318 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W EMP24P32803 203 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W YPC1P38298 316 aa6.35□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W SIT1P39980 628 aa6.35□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W SAS2P40963 338 aa6.35□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W ATP23P53722 227 aa6.35□□□□□ -1.39
YLR349WYLR349W SNO1Q03144 224 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 72.8 ms