RNA–Protein interactions for RNA: YLR008C

PAM18, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM18, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM18	YLR008C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	SPS2	P08459	502 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	LDB16	P25587	256 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	YCR022C	P25620	114 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	PEX4	P29340	183 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	CSE2	P33308	149 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	YEA6	P39953	335 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	MPM1	P40364	252 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	YIL024C	P40543	189 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	GPI2	P46961	280 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	DIE2	P50076	525 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	SCW10	Q04951	389 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	YPL278C	Q08990	100 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	YLR112W	Q12130	139 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	IZH2	Q12442	317 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	ECM29	P38737	1868 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PAM18	YLR008C	SMP1	P38128	452 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	PRM5	P40476	318 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	ATG18	P43601	500 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	TTI2	P47168	421 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	YGL088W	P53151	121 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	PIR3	Q03180	325 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	EMI1	Q04406	187 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	TVP18	Q04767	167 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	COA4	Q05809	96 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	DGK1	Q12382	290 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	HUT1	Q12520	339 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	YPR096C	O13587	100 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	TIM9	O74700	87 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	ZRT3	P34240	503 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	YER181C	P40097	107 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	YJL213W	P40896	331 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	YGR015C	P53208	328 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	BUD25	P85052	153 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	RNH202	Q05635	350 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	YLR042C	Q07990	161 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	FEX1	Q08913	375 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	YPL162C	Q12042	273 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	YDL211C	Q12121	372 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	YPR011C	Q12251	326 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	YLR111W	Q12528	110 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	ATP5	P09457	212 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	ANB1	P19211	157 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	IMP1	P28627	190 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	RNP1	P32385	249 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	HOT13	P36078	116 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	ECM31	P38122	312 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	YBR090C	P38253	122 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	YIL012W	P40551	113 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	SDS23	P53172	527 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	MET31	Q03081	177 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	ADD37	Q03233	198 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	NAT3	Q06504	195 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	FEX2	Q08991	375 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	KTI11	Q3E840	82 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	UBC5	P15732	148 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	LDS1	P31379	325 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.18	□□□□□ -1.9	not detected
PAM18	YLR008C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	SNM1	P40993	198 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	SBH1	P52870	82 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	YGL193C	P53097	103 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	FSH2	Q05015	223 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	MDM35	O60200	86 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	REP2	P03872	296 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	SDH3	P33421	198 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	IRC22	P40006	225 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	GRX5	Q02784	150 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	ELC1	Q03071	99 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	LPP1	Q04396	274 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAM18	YLR008C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9

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