RNA–Protein interactions for RNA: YKR019C

IRS4, Transcript of EH domain-containing protein, yeast

Gene IRS4, Length 1,848 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IRS4	YKR019C	ATX2	Q12067	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YRF1-6	P53819	1859 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	ADD37	Q03233	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	LPP1	Q04396	274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YPL278C	Q08990	100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	RAD28	Q12021	506 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YPR063C	Q12160	140 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YIL059C	P40520	121 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	SAY1	P53324	424 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	BSC1	Q12140	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	CYC7	P00045	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	COX10	P21592	462 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	LDS1	P31379	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	SRB6	P32570	121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	TEM1	P38987	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YGL193C	P53097	103 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YGL082W	P53155	381 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	ERV14	P53173	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	SLD7	Q08457	257 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	LYS2	P07702	1392 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	MRS4	P23500	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	MPM1	P40364	252 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	PHS1	P40857	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YMR103C	Q04436	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	KEI1	Q06346	221 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	IMP1	P28627	190 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YPR011C	Q12251	326 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	RAD6	P06104	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	SFT2	P38166	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	SHE1	P38200	338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	YFR045W	P43617	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	EMC4	P53073	190 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	OSH6	Q02201	448 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	EST3	Q03096	181 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	YMR252C	Q04814	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	YCR022C	P25620	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	MIX23	P38162	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	GAT4	P40569	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	CUP9	P41817	306 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	PAM16	P42949	149 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	PIR3	Q03180	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	FSH2	Q05015	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	ZRT3	P34240	503 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	YIL152W	P40455	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	YFL019C	P43576	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	RCE1	Q03530	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	SWC7	Q06707	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	DNF3	Q12674	1656 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	ATR1	P13090	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	SYS1	P41544	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	TMA10	Q06177	86 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	COQ2	P32378	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	TIM22	Q12328	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	HAP3	P13434	144 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	BET1	P22804	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	ERG2	P32352	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	PHO89	P38361	574 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	IPT1	P38954	527 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	HPA3	P39979	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	YGR164W	P53291	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	EMI1	Q04406	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	YOL014W	Q08110	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	RPB5	P20434	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	YIL012W	P40551	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	YLR112W	Q12130	139 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRS4	YKR019C	MED11	Q99278	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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