RNA–Protein interactions for RNA: YKL038W

RGT1, Transcript of Glucose-responsive transcription factor, yeast

Gene RGT1, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RGT1	YKL038W	ECM14	P38836	430 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	BNA2	P47125	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	UBC7	Q02159	165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	YJL213W	P40896	331 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	WSC2	P53832	503 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	YLR302C	O13544	120 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	YER076C	P40049	302 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	LTP1	P40347	161 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	SBH2	P52871	88 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	SUT2	Q12286	268 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	MDH2	P22133	377 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	AHT1	P29589	182 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RGT1	YKL038W	HUA1	P40325	198 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	DFG10	P40526	253 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	CRH1	P53301	507 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	ATG33	Q06485	197 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	APQ12	P40532	138 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YMR007W	Q03675	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	IRC25	Q07951	179 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YDR029W	Q12111	104 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	USV1	Q12132	391 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	SPC29	P33419	253 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YOR062C	P36025	268 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	PRY1	P47032	299 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	PIR3	Q03180	325 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	VPS71	Q03433	280 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	ERG8	P24521	451 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	IML3	P38265	245 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	CPT1	P17898	393 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	ANS1	P38832	159 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	SNF11	P38956	169 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	TIM17	P39515	158 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YEL068C	P39977	110 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YGL235W	P53071	178 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	RSF1	Q05043	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	HPA2	Q06592	156 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	DGA1	Q08650	418 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	STT4	P37297	1900 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	COX10	P21592	462 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	BUD8	P41698	603 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	DAP1	Q12091	152 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YGL118C	P53132	145 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YMR321C	Q04898	105 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	CTA1	P15202	515 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	ERG2	P32352	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YFR057W	P43625	151 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	JJJ3	P47138	172 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YLR152C	P54072	576 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	GEP3	Q08622	556 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	CMC1	P36064	111 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	XBP1	P40489	647 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	GEP7	P53171	287 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YMR320W	Q04897	101 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	AYT1	Q12226	474 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	MSB2	P32334	1306 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	CCH1	P50077	2039 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	YBL059W	P34224	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	TIM12	P32830	109 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	REC114	P32841	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	VMA11	P32842	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
RGT1	YKL038W	GPI2	P46961	280 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RGT1	YKL038W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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