RNA–Protein interactions for RNA: YJL135W

YJL135W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL135W, Length 318 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL135W	YJL135W	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YJL135W	YJL135W	TRM3	Q07527	1436 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YJL135W	YJL135W	KIN28	P06242	306 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YJL135W	YJL135W	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YJL135W	YJL135W	NVJ1	P38881	321 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YJL135W	YJL135W	YEL073C	P39974	107 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YJL135W	YJL135W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YJL135W	YJL135W	YGR269W	P40326	108 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YJL135W	YJL135W	CIN5	P40917	295 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YJL135W	YJL135W	TTI2	P47168	421 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YJL135W	YJL135W	PAC10	P48363	199 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YJL135W	YJL135W	HOP2	P53187	214 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YJL135W	YJL135W	SED1	Q01589	338 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YJL135W	YJL135W	SNO1	Q03144	224 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YJL135W	YJL135W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YJL135W	YJL135W	YET3	Q07451	203 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YJL135W	YJL135W	APA2	P22108	325 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YJL135W	YJL135W	YKR041W	P36134	250 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YJL135W	YJL135W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
YJL135W	YJL135W	APS3	P47064	194 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YJL135W	YJL135W	GEP7	P53171	287 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YJL135W	YJL135W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
YJL135W	YJL135W	VAM10	Q08474	114 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YJL135W	YJL135W	TAF2	P23255	1407 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	NUF2	P33895	451 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	HHY1	P39982	102 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	YEL028W	P39989	153 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	XPT1	P47165	209 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	SOL1	P50278	321 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	JAC1	P53193	184 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	SYM1	Q06563	197 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	SPS2	P08459	502 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	CSH1	P38287	376 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	UIP4	Q08926	304 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	PEX11	Q12462	236 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	ATP7	P30902	174 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	YBR027C	P38220	110 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	LIP1	Q03579	150 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	PLP1	Q04004	230 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	YOR072W	Q08486	104 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	INO4	P13902	151 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	SPT14	P32363	452 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	PTC1	P35182	281 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	ECM31	P38122	312 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	YEL014C	P39999	101 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	MGR2	Q02889	113 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	HAP2	P06774	265 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	LAA1	P39526	2014 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	GLC8	P41818	229 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	CCC1	P47818	322 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	YDL241W	Q07738	123 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	ATG10	Q07879	167 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	BLM10	P43583	2143 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	GIM3	P53900	129 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	THI74	Q04083	370 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	YPR114W	Q06107	315 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	GRE1	Q08969	168 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	CMC4	Q3E7A9	73 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
YJL135W	YJL135W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	RAD51	P25454	400 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	HSP150	P32478	413 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	YMR141C	P40211	102 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	YNR064C	P53750	290 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	TAO3	P40468	2376 aa		0.14	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	RPL43B	P0CX26	92 aa		0.14	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	0.14	□□□□□ -2.39	not detected
YJL135W	YJL135W	SRP14	P38985	146 aa		0.14	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	YNL140C	P53910	189 aa		0.14	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	YLR046C	Q12253	270 aa		0.14	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		0.14	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	ATP5	P09457	212 aa		0.13	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		0.13	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	IPT1	P38954	527 aa		0.13	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	YIP3	P53633	176 aa		0.13	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	HSK3	P69852	69 aa		0.13	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	FMN1	Q03778	218 aa		0.13	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	YDR102C	Q03864	110 aa		0.13	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	HSL1	P34244	1518 aa		0.13	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
YJL135W	YJL135W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39

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