RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C

MSC7, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene MSC7, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSC7	YHR039C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	TFS1	P14306	219 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	SPO13	P23624	291 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	YBR063C	P38083	404 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	SDS24	P38314	527 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	TOS2	P50078	622 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	ERV29	P53337	310 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	YDR215C	Q12240	137 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	YPR064W	Q12492	139 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	CDC43	P18898	376 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	YMC2	P38087	329 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	CSH1	P38287	376 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	SPO73	P40031	143 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	CYB5	P40312	120 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	SCW11	P53189	542 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	BUD25	P85052	153 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	SPR6	Q01684	191 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	CSR2	Q12734	1121 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	MHF1	Q3E835	90 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	HEM2	P05373	342 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	PAM17	P36147	197 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	FIP1	P45976	327 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	RAF1	Q06891	181 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	RFM1	Q12192	310 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	YGL010W	P25338	174 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	MRP17	P28778	131 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	URA10	P30402	227 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	ZRT3	P34240	503 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	APS1	P35181	156 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	MRP21	P38175	177 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	YER134C	P40081	178 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	YNL198C	P40166	100 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	EMC4	P53073	190 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	VHT1	P53241	593 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	RNH201	P53942	307 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	ARR3	Q06598	404 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	YOL160W	Q08321	113 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	YPL229W	Q99395	206 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	TRP1	P00912	224 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	ATX1	P38636	73 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	YJL213W	P40896	331 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	UBP8	P50102	471 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	CAX4	P53223	239 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	ROT1	Q03691	256 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	JID1	Q12350	301 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	TSC3	Q3E790	80 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	YCR085W	P25650	117 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	CDC5	P32562	705 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	ARN2	P38724	620 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	PAU15	P40585	124 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	YPS5	P53057	165 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	RIM8	P53179	542 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	SWS2	P53937	143 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	YMR252C	Q04814	134 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.04	□□□□□ -1.76	not detected
MSC7	YHR039C	YDL180W	Q12301	547 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	SFT2	P38166	215 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	PHO89	P38361	574 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	YER181C	P40097	107 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	YNL195C	P40168	261 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	GAT4	P40569	121 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	TIM18	Q08749	192 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	KRE1	P17260	313 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	SHE1	P38200	338 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	MPM1	P40364	252 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	TDA4	P47153	279 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	UBC13	P52490	153 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	SPG4	Q04438	115 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	AVO2	Q04749	426 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	ASM4	Q05166	528 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	SWM1	Q12379	170 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
MSC7	YHR039C	MRS4	P23500	304 aa		4.02	□□□□□ -1.77
MSC7	YHR039C	DSS4	P32601	143 aa		4.02	□□□□□ -1.77
MSC7	YHR039C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.02	□□□□□ -1.77	not detected
MSC7	YHR039C	MIX23	P38162	196 aa		4.02	□□□□□ -1.77
MSC7	YHR039C	PEX17	P40155	199 aa		4.02	□□□□□ -1.77
MSC7	YHR039C	KEG1	P43614	200 aa		4.02	□□□□□ -1.77

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