RNA–Protein interactions for RNA: YBL008W

HIR1, Transcript of Subunit of the HIR complex, yeast

Gene HIR1, Length 2,523 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HIR1	YBL008W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	LCL3	P53153	274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	RAV2	Q03956	351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	TGS1	Q12052	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	NNK1	P36003	928 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	AGE2	P40529	298 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	YFL015C	P43578	164 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	RPA43	P46669	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	GPI2	P46961	280 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	MIC26	P50087	233 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	UTR5	P32630	166 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	FZF1	P32805	299 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	SAS2	P40963	338 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	MIC27	P50945	234 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	HNT3	Q08702	217 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	YKR073C	P36153	106 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	ATO3	Q12359	275 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	COX1	P00401	534 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	ROX3	P25046	220 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	YER084W	P40057	128 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	ECO1	P43605	281 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	SAL1	D6W196	494 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	SEC11	P15367	167 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	PAU16	P35994	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	YIL029C	P40538	142 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	HAC1	P41546	238 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	IRC25	Q07951	179 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	PRY2	P36110	329 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	YDL183C	P48569	320 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	BOR1	P53838	576 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	RFU1	Q08003	200 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	HTB2	P02294	131 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	GON7	P46984	123 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	SFT2	P38166	215 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	PCP1	P53259	346 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	DAP1	Q12091	152 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	TRA1	P38811	3744 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	UME6	P39001	836 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	TVP18	Q04767	167 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	TRI1	Q05024	226 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	CYB5	P40312	120 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	YFR045W	P43617	309 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	CRZ1	P53968	678 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	PAU23	Q07987	124 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	HRD1	Q08109	551 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	PAU17	Q12370	124 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	QRI5	P32344	111 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	YMR141C	P40211	102 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	UBC13	P52490	153 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	COX18	P53239	316 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	SOH1	P38633	127 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	EGT2	P42835	1041 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	YGL230C	P53074	147 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	YGR017W	P53210	297 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	YDL129W	Q07555	291 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	CDC26	P14724	124 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	ERG8	P24521	451 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	AIM29	P36154	155 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	RPL39	P04650	51 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	DDI2	P0CH63	225 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	DDI3	P0CH64	225 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HIR1	YBL008W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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