RNA–Protein interactions for RNA: YML058W-A

HUG1, Transcript of Protein involved in the Mec1p-mediated checkpoint pathway, yeast

Gene HUG1, Length 207 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HUG1	YML058W-A	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	BUD25	P85052	153 aa		0.37	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	FIT1	Q04433	528 aa		0.37	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	GAL83	Q04739	417 aa		0.37	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	RNH202	Q05635	350 aa		0.37	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	YLR194C	Q05777	254 aa		0.37	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	RRT7	Q07829	113 aa		0.37	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	FEX1	Q08913	375 aa		0.37	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	FEX2	Q08991	375 aa		0.37	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	TRP1	P00912	224 aa		0.36	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	IKI1	P38874	309 aa		0.36	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	PEP8	P40335	379 aa		0.36	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	TPN1	P53099	579 aa		0.36	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	YGR025W	P53216	100 aa		0.36	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	GPI1	P53306	609 aa		0.36	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	YMR010W	Q03687	405 aa		0.36	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	YLR413W	Q06689	675 aa		0.36	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	RAD28	Q12021	506 aa		0.36	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		0.36	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	Q0017	Q9ZZX8	53 aa		0.36	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	YHR213W	P0CI67	198 aa		0.35	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	CBF1	P17106	351 aa		0.35	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	YCR101C	P25607	182 aa		0.35	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	ARO7	P32178	256 aa		0.35	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	TCD1	P38756	429 aa		0.35	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	PEX22	P39718	180 aa		0.35	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	POP6	P53218	158 aa		0.35	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	ODC1	Q03028	310 aa		0.35	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	SPC19	Q03954	165 aa		0.35	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	RRT8	Q08219	342 aa		0.35	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	APC9	Q12107	265 aa		0.35	□□□□□ -2.35
HUG1	YML058W-A	YMR31	P19955	123 aa		0.34	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	PTP2	P29461	750 aa		0.34	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	ERG3	P32353	365 aa		0.34	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	MRPL6	P32904	214 aa		0.34	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	RRT1	P38192	103 aa		0.34	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	LCB3	P47013	409 aa		0.34	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	MRM2	P53123	320 aa		0.34	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	SNA2	P56508	79 aa		0.34	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	MRPS9	P38120	278 aa		0.33	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	YBR285W	P38354	144 aa		0.33	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	CIN4	P39110	191 aa		0.33	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	SSO2	P39926	295 aa		0.33	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	AIM20	P40451	204 aa		0.33	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	DFG10	P40526	253 aa		0.33	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	MGA1	P53050	456 aa		0.33	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	MRPS16	Q02608	121 aa		0.33	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	OST6	Q03723	332 aa		0.33	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	SMP3	Q04174	516 aa		0.33	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	YMR320W	Q04897	101 aa		0.33	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.33	□□□□□ -2.36	not detected
HUG1	YML058W-A	YOL118C	Q08259	102 aa		0.33	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	CCW12	Q12127	133 aa		0.33	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		0.33	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	SAS5	Q99314	248 aa		0.33	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	YLR302C	O13544	120 aa		0.32	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.32	□□□□□ -2.36	not detected
HUG1	YML058W-A	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	0.32	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	FMT1	P32785	401 aa		0.32	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	DLS1	P40366	167 aa		0.32	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	YCH1	P42937	148 aa		0.32	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	BNS1	P50084	137 aa		0.32	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	YNG1	Q08465	219 aa		0.32	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	SCM3	Q12334	223 aa		0.32	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	ECM12	O13529	151 aa		0.31	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	0.31	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	MRPL17	P36528	281 aa		0.31	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	RIB5	P38145	238 aa		0.31	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	MED8	P38304	223 aa		0.31	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	MBB1	P39534	108 aa		0.31	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	URB2	P47108	1174 aa		0.31	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	USE1	P53146	245 aa		0.31	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	YGR016W	P53209	190 aa		0.31	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.31	□□□□□ -2.36
HUG1	YML058W-A	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		0.31	□□□□□ -2.36

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