RNA–Protein interactions for RNA: YLR363C

NMD4, Transcript of Protein that may be involved in nonsense-mediated mRNA decay, yeast

Gene NMD4, Length 657 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NMD4	YLR363C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
NMD4	YLR363C	IPT1	P38954	527 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NMD4	YLR363C	YER121W	P40076	114 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NMD4	YLR363C	YER188W	P40103	239 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NMD4	YLR363C	SWM2	P40342	146 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NMD4	YLR363C	NSE4	P43124	402 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NMD4	YLR363C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
NMD4	YLR363C	YIP5	P53108	310 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NMD4	YLR363C	YGL159W	P53110	370 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NMD4	YLR363C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
NMD4	YLR363C	YNL046W	P53956	172 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NMD4	YLR363C	DIA1	P54005	336 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NMD4	YLR363C	SED1	Q01589	338 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NMD4	YLR363C	GMC1	Q04399	608 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NMD4	YLR363C	ECM18	Q04623	453 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NMD4	YLR363C	PEX30	Q06169	523 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NMD4	YLR363C	IPK1	Q06667	281 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NMD4	YLR363C	HRT1	Q08273	121 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NMD4	YLR363C	TIM9	O74700	87 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	DDI2	P0CH63	225 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	DDI3	P0CH64	225 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	SNF6	P18888	332 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	PPA2	P28239	310 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	ZRT3	P34240	503 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	GPI18	P38211	433 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	POG1	P40473	351 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	YIR020C	P40575	100 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	YJR012C	P47087	207 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	JAC1	P53193	184 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	YDR391C	Q04170	232 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	SHH3	Q04487	196 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	SCP1	Q08873	200 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	RNH203	Q12338	110 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	FRE6	Q12473	712 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	MRPS9	P38120	278 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	YPC1	P38298	316 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	SPO73	P40031	143 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	NAS2	P40555	220 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	NUP49	Q02199	472 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	DYN2	Q02647	92 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	FCY22	Q12119	530 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	POM33	Q12164	279 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	MCT1	Q12283	360 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	BPH1	P25356	2167 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	COX5B	P00425	151 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	SGA1	P08019	549 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	HAP3	P13434	144 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	ZRC1	P20107	442 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	MCH2	P36032	473 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	QDR3	P38227	689 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	YHR035W	P38769	630 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	WSS1	P38838	269 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	CHL4	P38907	458 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	DAN1	P47178	298 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	YGL185C	P53100	379 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	PRM8	P53174	237 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	YNR066C	P53752	436 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	ATG39	Q06159	398 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	GAT3	Q07928	141 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	YLR126C	Q12288	251 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	TFC7	Q12415	435 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	SLO1	Q3E784	85 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	VMA9	Q3E7B6	73 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	PET18	P25362	215 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	MRPL6	P32904	214 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	UPS2	P35200	230 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	YKL075C	P36083	450 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	3.74	□□□□□ -1.81	not detected
NMD4	YLR363C	BDH1	P39714	382 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	YER085C	P40058	173 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	YPS5	P53057	165 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	YDR366C	P87287	132 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	OPI3	P05375	206 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	RPL12B	P0CX54	165 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	ACB1	P31787	87 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	OTU1	P43558	301 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	YHC3	P47040	408 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	ERV29	P53337	310 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	APJ1	P53940	528 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NMD4	YLR363C	YPL077C	Q02831	240 aa		3.73	□□□□□ -1.81

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