RNA–Protein interactions for RNA: YKL085W

MDH1, Transcript of Mitochondrial malate dehydrogenase, yeast

Gene MDH1, Length 1,005 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDH1	YKL085W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	CPD1	P53314	239 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	HRD1	Q08109	551 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	QDR3	P38227	689 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	RRF1	P38771	230 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	YKE4	P40544	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	HXT14	P42833	540 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	MRPS16	Q02608	121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	FSH2	Q05015	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	MED4	Q12343	284 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	UBA3	Q99344	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	FMT1	P32785	401 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	PPQ1	P32945	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	MRPL3	P36516	390 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	PLP1	Q04004	230 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	VBA1	Q04301	562 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDH1	YKL085W	MRS3	P10566	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	SWM2	P40342	146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	SNX4	P47057	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	YML018C	Q03730	393 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	PHO92	Q06390	306 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	SPS2	P08459	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	YPT10	P38146	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	YAR068W	P39564	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	HPA3	P39979	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	IRC24	P40580	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	CAT5	P41735	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	AGX1	P43567	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	YPI1	P43587	155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	ERV29	P53337	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	SYM1	Q06563	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	LAC1	P28496	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	PET100	P38958	111 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	YFR035C	P43608	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	ATG39	Q06159	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	YNG1	Q08465	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	PET20	Q99373	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	CYC3	P06182	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	RNP1	P32385	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	SIM1	P40472	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	DFG10	P40526	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	GIM3	P53900	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	COX12	Q01519	83 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	COA4	Q05809	96 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	RAD28	Q12021	506 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	VMA7	P39111	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	AIM25	P47140	327 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	ALG13	P53178	202 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	DAD2	P36162	133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	DOG2	P38773	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	DOG1	P38774	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	TDA4	P47153	279 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	MIC26	P50087	233 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
MDH1	YKL085W	YML108W	Q03759	105 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	THI74	Q04083	370 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	FEX1	Q08913	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	FEX2	Q08991	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	ATG31	Q12421	196 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	CPR4	P25334	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	YHR122W	P38829	231 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	UIP3	P39547	235 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	MST28	P39552	234 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	MST27	P53176	234 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	SCP1	Q08873	200 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	ATG5	Q12380	294 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	PRM4	Q12498	284 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDH1	YKL085W	POP8	P38208	133 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDH1	YKL085W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MDH1	YKL085W	FYV6	P53913	173 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDH1	YKL085W	DID2	P69771	204 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDH1	YKL085W	EST3	Q03096	181 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDH1	YKL085W	RRG8	Q06109	277 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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