RNA–Protein interactions for RNA: YJR079W

YJR079W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YJR079W, Length 330 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJR079W	YJR079W	YFL019C	P43576	117 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YJR079W	YJR079W	YGL235W	P53071	178 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YJR079W	YJR079W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YJR079W	YJR079W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YJR079W	YJR079W	NSG1	P38837	291 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YJR079W	YJR079W	DCV1	P43595	202 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YJR079W	YJR079W	NRK1	P53915	240 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YJR079W	YJR079W	FIT1	Q04433	528 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YJR079W	YJR079W	DAS2	Q12084	232 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YJR079W	YJR079W	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YJR079W	YJR079W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YJR079W	YJR079W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YJR079W	YJR079W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YJR079W	YJR079W	YAR064W	P39563	99 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	CGR1	P53188	120 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	YOL024W	Q08172	172 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	YOR342C	Q12182	319 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	QCR7	P00128	127 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	ETR1	P38071	380 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	FMP23	P38231	175 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	SBH1	P52870	82 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	PGA1	P53896	198 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	HHT1	P61830	136 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	ARO80	Q04052	950 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	YHP1	Q04116	353 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	CCW12	Q12127	133 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	MAK31	P23059	88 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	CAF4	P36130	643 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	MPM1	P40364	252 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	ATP20	Q12233	115 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	TRX3	P25372	127 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	0.55	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	NSE4	P43124	402 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	YJR015W	P47090	510 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	DML1	Q03652	475 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	AIM34	Q03673	198 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.54	□□□□□ -2.32	not detected
YJR079W	YJR079W	ADE1	P27616	306 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.54	□□□□□ -2.32	not detected
YJR079W	YJR079W	RRT1	P38192	103 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	FMP32	P43557	207 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	ELP6	Q04868	273 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	UPS1	Q05776	175 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	ATG41	Q12048	136 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	HSP30	P25619	332 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	0.53	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	VPS28	Q02767	242 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	0.53	□□□□□ -2.32
YJR079W	YJR079W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	YDC1	Q02896	317 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	JIP3	O13555	125 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	GAL83	Q04739	417 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	SHH4	Q06236	168 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	KEI1	Q06346	221 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	AHC2	P25649	128 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	SHG1	P38337	142 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	TIM13	P53299	105 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	RFC2	P40348	353 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	MOB1	P40484	314 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	YGL230C	P53074	147 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	YKR005C	Q02203	525 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	TMA23	Q03525	211 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	RIM9	Q04734	239 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	YOR214C	Q12282	236 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	RAD9	P14737	1309 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	YKL102C	P34249	101 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	GPI17	Q04080	534 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	GRX8	Q05926	109 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	YPR127W	Q06494	345 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	YCR001W	P25347	104 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	YML079W	Q03629	201 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	YET3	Q07451	203 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	HRD1	Q08109	551 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	YDL157C	Q12082	118 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YJR079W	YJR079W	RAD6	P06104	172 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJR079W	YJR079W	CLG1	P35190	452 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJR079W	YJR079W	FCY1	Q12178	158 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJR079W	YJR079W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YJR079W	YJR079W	YEL073C	P39974	107 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR079W	YJR079W	POG1	P40473	351 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR079W	YJR079W	CIN5	P40917	295 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR079W	YJR079W	TTI2	P47168	421 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR079W	YJR079W	PAC10	P48363	199 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR079W	YJR079W	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJR079W	YJR079W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YJR079W	YJR079W	YGR269W	P40326	108 aa		0.44	□□□□□ -2.34

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