RNA–Protein interactions for RNA: YHR193C

EGD2, Transcript of Alpha subunit of the nascent polypeptide-associated complex (NAC), yeast

Gene EGD2, Length 525 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EGD2	YHR193C	AFR1	P33304	620 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	CMC1	P36064	111 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	LAG1	P38703	411 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	CAT5	P41735	233 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	DYN2	Q02647	92 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	MRPS8	Q03799	155 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	YPR195C	Q06594	109 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	YPL162C	Q12042	273 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	PRM7	Q12459	698 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	AVT5	P38176	459 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	COS8	P38723	381 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.17	□□□□□ -1.74	not detected
EGD2	YHR193C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	NRG1	Q03125	231 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	POS5	Q06892	414 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	CPR4	P25334	318 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	PTC7	P38797	343 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	MIT1	P40002	666 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	YGR050C	P53231	118 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	SPO19	Q03029	223 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	PRM4	Q12498	284 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	YCR022C	P25620	114 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	POP8	P38208	133 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	GOS1	P38736	223 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	BDH1	P39714	382 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	YGR018C	P53211	109 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	ANB1	P19211	157 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	ERV15	P38312	142 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	WSS1	P38838	269 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	MIG3	P39943	394 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	YER135C	P40082	130 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	YJR015W	P47090	510 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	MCM22	P47167	239 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	DCS1	Q06151	350 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	FRQ1	Q06389	190 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	LOA1	Q06508	300 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
EGD2	YHR193C	YPR063C	Q12160	140 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	YPS3	Q12303	508 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	CSH1	P38287	376 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	GLE2	P40066	365 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	YIR035C	P40579	254 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	LCB3	P47013	409 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	YGR025W	P53216	100 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	UBC7	Q02159	165 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	SDH7	Q04401	133 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	LCL2	Q08045	131 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	YOR385W	Q08909	290 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	QCR2	P07257	368 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	CUP2	P15315	225 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	VMA16	P23968	213 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	FPR2	P32472	135 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	RRF1	P38771	230 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	YHR122W	P38829	231 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	HXT14	P42833	540 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	CDC7	P06243	507 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	MRP17	P28778	131 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	GPX2	P38143	162 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	ORM1	P53224	222 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	LST7	P53237	242 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	TMA17	Q12513	150 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	IMP2	P46972	177 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	SCM3	Q12334	223 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	NNK1	P36003	928 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	MBA1	P38300	278 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	AIM25	P47140	327 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	HST4	P53688	370 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	CPR8	P53728	308 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	HCH1	P53834	153 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	YOL160W	Q08321	113 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	PEX27	Q08580	376 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	MSH5	Q12175	901 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EGD2	YHR193C	YCR025C	P25352	136 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	YPT53	P36019	220 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	HPA3	P39979	161 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EGD2	YHR193C	IRC22	P40006	225 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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