RNA–Protein interactions for RNA: YHR101C

BIG1, Transcript of Integral membrane protein of the endoplasmic reticulum, yeast

Gene BIG1, Length 1,008 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BIG1	YHR101C	YGL235W	P53071	178 aa		0.27	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	PGA2	P53903	129 aa		0.27	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	DGK1	Q12382	290 aa		0.27	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	ETR1	P38071	380 aa		0.26	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		0.26	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	MAK31	P23059	88 aa		0.25	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	NTG1	P31378	399 aa		0.25	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	MPM1	P40364	252 aa		0.25	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	YFL019C	P43576	117 aa		0.25	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	YJR015W	P47090	510 aa		0.25	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	MMS2	P53152	137 aa		0.25	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	PIR1	Q03178	341 aa		0.25	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	YHP1	Q04116	353 aa		0.25	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	ELP6	Q04868	273 aa		0.25	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	DAS2	Q12084	232 aa		0.25	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		0.25	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	FMP23	P38231	175 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	YNL184C	P53876	108 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	NRK1	P53915	240 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	YDC1	Q02896	317 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	YOR342C	Q12182	319 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	NSG1	P38837	291 aa		0.23	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	NSE4	P43124	402 aa		0.23	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	RTC4	P53850	401 aa		0.23	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	PGA1	P53896	198 aa		0.23	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	HHT1	P61830	136 aa		0.23	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	SED1	Q01589	338 aa		0.23	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	TMA23	Q03525	211 aa		0.23	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	DML1	Q03652	475 aa		0.23	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	ARO80	Q04052	950 aa		0.23	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	UPS1	Q05776	175 aa		0.23	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	KEI1	Q06346	221 aa		0.23	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	ATP20	Q12233	115 aa		0.23	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		0.23	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	IGO2	Q9P305	131 aa		0.23	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	CBF1	P17106	351 aa		0.22	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.22	□□□□□ -2.37	not detected
BIG1	YHR101C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	RRT1	P38192	103 aa		0.22	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	SBH1	P52870	82 aa		0.22	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	PRM3	Q08931	133 aa		0.22	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	ATG41	Q12048	136 aa		0.22	□□□□□ -2.37
BIG1	YHR101C	YCR001W	P25347	104 aa		0.21	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	YGL230C	P53074	147 aa		0.21	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	YOL024W	Q08172	172 aa		0.21	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	QCR7	P00128	127 aa		0.2	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		0.2	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		0.2	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.2	□□□□□ -2.38	not detected
BIG1	YHR101C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	HSP30	P25619	332 aa		0.2	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	ADE1	P27616	306 aa		0.2	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	GAL83	Q04739	417 aa		0.2	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	RNH1	Q04740	348 aa		0.2	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		0.2	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		0.2	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	BLM10	P43583	2143 aa		0.19	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	FMP32	P43557	207 aa		0.19	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	VPS28	Q02767	242 aa		0.19	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	AIM34	Q03673	198 aa		0.19	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	LAA1	P39526	2014 aa		0.18	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	AHC2	P25649	128 aa		0.18	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	HHY1	P39982	102 aa		0.18	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	RIM9	Q04734	239 aa		0.18	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	FCY1	Q12178	158 aa		0.18	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	JIP3	O13555	125 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	TRX3	P25372	127 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	CLG1	P35190	452 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	CAF4	P36130	643 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	POG1	P40473	351 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	MOB1	P40484	314 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	CIN5	P40917	295 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	PAC10	P48363	199 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	CGR1	P53188	120 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	TIM13	P53299	105 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	YKR005C	Q02203	525 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	YML079W	Q03629	201 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	YPR127W	Q06494	345 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	YOR214C	Q12282	236 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	KIN28	P06242	306 aa		0.16	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	YKL102C	P34249	101 aa		0.16	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	RFC2	P40348	353 aa		0.16	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	APS3	P47064	194 aa		0.16	□□□□□ -2.38
BIG1	YHR101C	GPI17	Q04080	534 aa		0.16	□□□□□ -2.38

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.3 ms