RNA–Protein interactions for RNA: YBL008W

HIR1, Transcript of Subunit of the HIR complex, yeast

Gene HIR1, Length 2,523 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HIR1	YBL008W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HIR1	YBL008W	IZH1	Q03419	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HIR1	YBL008W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HIR1	YBL008W	IZH3	Q07959	543 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HIR1	YBL008W	RNH203	Q12338	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HIR1	YBL008W	COX2	P00410	251 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HIR1	YBL008W	PEX4	P29340	183 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HIR1	YBL008W	HMX1	P32339	317 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HIR1	YBL008W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
HIR1	YBL008W	YNL165W	P53891	406 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HIR1	YBL008W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HIR1	YBL008W	COQ11	Q05892	277 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HIR1	YBL008W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
HIR1	YBL008W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HIR1	YBL008W	ATP5	P09457	212 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	HAP3	P13434	144 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	DAL3	P32459	195 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	DFG10	P40526	253 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	PGU1	P47180	361 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	NIS1	P53939	407 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	YDR366C	P87287	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	POS5	Q06892	414 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	YOR105W	Q08504	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	REC104	P33323	182 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	YKL075C	P36083	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	YDC1	Q02896	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	UPS3	Q04006	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	ATG40	Q99325	256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	ADE8	P04161	214 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	SPS18	P32572	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	TCA17	P32613	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	SRP14	P38985	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	TDA4	P47153	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	ATC1	Q04005	294 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	YOS1	Q3E834	85 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	QCR9	P22289	66 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	AFR1	P33304	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	MTC6	P38849	526 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	COX15	P40086	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	PIN3	Q06449	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	MCH1	Q07376	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	UBS1	P38290	277 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	TEM1	P38987	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	PRY1	P47032	299 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	MRPS5	P33759	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	SDS23	P53172	527 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	DUG3	P53871	357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	MRL1	Q06815	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	MIX23	P38162	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	CPD1	P53314	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	TOM7	P53507	60 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	HSK3	P69852	69 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	ERS1	P17261	260 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	YKL187C	P34231	750 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	YUH1	P35127	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	YBR184W	P38299	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	RPB11	P38902	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	BDH1	P39714	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	YAP6	Q03935	383 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	RKI1	Q12189	258 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	RFM1	Q12192	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	ZRT1	P32804	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	ATG4	P53867	494 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	NUP53	Q03790	475 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	DOG1	P38774	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	YGR151C	P53287	111 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	HED1	Q03937	162 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	LPP1	Q04396	274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	GIM5	Q04493	163 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIR1	YBL008W	FLO9	P39712	1322 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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