RNA–Protein interactions for RNA: tW(UCA)Q

tW(UCA)Q, Transcript of Mitochondrial tRNA, annotated as tryptophanyl tRNA (tRNA-Trp), yeastyeast

Gene tW(UCA)Q, Length 74 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(UCA)QtW(UCA)Q YBL010CP32788 280 aa-0.37□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q LDB7P38210 180 aa-0.37□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q ARP3P47117 449 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q GCN3P14741 305 aa-0.38□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q YCR023CP25351 611 aa-0.38□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q YKR070WP36151 352 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q ETR1P38071 380 aa-0.38□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q YER134CP40081 178 aa-0.38□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q FMC1P40491 155 aa-0.38□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q PDR17P53844 350 aa-0.38□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q GGA1Q06336 557 aa-0.38□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q HFA1P32874 2273 aa-0.39□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q YAR023CD6VPM8 179 aa-0.39□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q HMF1P40037 129 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q ERG10P41338 398 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q LSM7P53905 115 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q PST2Q12335 198 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q YHR214C-EQ8TGK0 99 aa-0.39□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNL033WP53964 284 aa-0.4□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q YIL177CP40434 1758 aa-0.4□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q YJL225CP40889 1758 aa-0.4□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q STF2P16965 84 aa-0.41□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q AIM2P39721 246 aa-0.41□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q YGL235WP53071 178 aa-0.41□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q ALG13P53178 202 aa-0.41□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOR015WQ12169 119 aa-0.41□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q ADF1Q2V2Q1 113 aa-0.41□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q BMH2P34730 273 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q PAM17P36147 197 aa-0.42□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q IRC18P47056 224 aa-0.42□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR030W-AQ3E760 96 aa-0.42□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR307C-AQ3E825 87 aa-0.42□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL43BP0CX26 92 aa-0.43□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q SNF4P12904 322 aa-0.43□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q TRM5P38793 499 aa-0.43□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q MTW1P39731 289 aa-0.43□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q PDS1P40316 373 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q MPM1P40364 252 aa-0.43□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q SER2P42941 309 aa-0.43□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q SKI6P46948 246 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q YKR005CQ02203 525 aa-0.43□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q DGK1Q12382 290 aa-0.43□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q SHB17P36136 271 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q CUP9P41817 306 aa-0.44□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q YGL230CP53074 147 aa-0.44□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q MDM32Q12171 622 aa-0.44□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL28P02406 149 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q TIR1P10863 254 aa-0.45□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q PRE1P22141 198 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q MAK31P23059 88 aa-0.45□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q CNB1P25296 175 aa-0.45□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q MGT1P26188 188 aa-0.45□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q VMA6P32366 345 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q FUS2Q05670 677 aa-0.45□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q IDP1P21954 428 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q YCR016WP25617 290 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q MSN4P33749 630 aa-0.46□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q YUH1P35127 236 aa-0.46□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q YHP1Q04116 353 aa-0.46□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR253CQ04835 414 aa-0.46□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR31P19955 123 aa-0.47□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR141CP40211 102 aa-0.47□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q RRT8Q08219 342 aa-0.47□□□□□ -2.48
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR157W-EP0CF00 54 aa-0.48□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q MATALPHA1P0CY06 175 aa-0.48□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q HMLALPHA1P0CY07 175 aa-0.48□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q MER1P16523 270 aa-0.48□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL24BP24000 155 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q PPA2P28239 310 aa-0.48□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q RIB7P33312 244 aa-0.48□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPC25P40014 221 aa-0.48□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q GRX5Q02784 150 aa-0.48□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q KIN28P06242 306 aa-0.49□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q PET117Q02771 107 aa-0.49□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q PIR1Q03178 341 aa-0.49□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q THP2O13539 261 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q CIN5P40917 295 aa-0.5□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q NSE4P43124 402 aa-0.5□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q HHT1P61830 136 aa-0.5□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q SEN15Q04675 128 aa-0.5□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR036CQ07986 203 aa-0.5□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOR072WQ08486 104 aa-0.5□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q FCY1Q12178 158 aa-0.5□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q YBR121C-AP0C5L4 52 aa-0.51□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q ERG28P40030 148 aa-0.51□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q CCS1P40202 249 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q YRB1P41920 201 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q NAT3Q06504 195 aa-0.51□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q MBF1O14467 151 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q RHO1P06780 209 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q NTG1P31378 399 aa-0.52□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q TAF14P35189 244 aa-0.52□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q MIC12P38341 106 aa-0.52□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q MOB1P40484 314 aa-0.52□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 42.2 ms