RNA–Protein interactions for RNA: YMR163C

INP2, Transcript of Peroxisome-specific receptor important for peroxisome inheritance, yeast

Gene INP2, Length 2,118 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
INP2	YMR163C	NCB2	Q92317	146 aa		0.26	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	PHO85	P17157	305 aa		0.25	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	TAF14	P35189	244 aa		0.25	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	RAD17	P48581	401 aa		0.25	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	YPR013C	Q12145	317 aa		0.25	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	MDM32	Q12171	622 aa		0.25	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	TAO3	P40468	2376 aa		0.25	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	CNB1	P25296	175 aa		0.25	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	YCR087C-A	P37263	153 aa		0.25	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	TRM5	P38793	499 aa		0.25	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	MSS2	P40990	351 aa		0.25	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	AIM25	P47140	327 aa		0.25	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	UPS3	Q04006	179 aa		0.25	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	YDR391C	Q04170	232 aa		0.25	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	STE18	P18852	110 aa		0.24	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	COQ1	P18900	473 aa		0.24	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	UGX2	P32772	223 aa		0.24	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	UBC12	P52491	188 aa		0.24	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		0.23	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	ARG80	P07249	177 aa		0.23	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	SEN2	P16658	377 aa		0.23	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	MRPL15	P36523	253 aa		0.23	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	IKI1	P38874	309 aa		0.23	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	SER2	P42941	309 aa		0.23	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	MET31	Q03081	177 aa		0.23	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	BNA7	Q04066	261 aa		0.23	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	DYN3	Q04949	312 aa		0.23	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	YER134C	P40081	178 aa		0.23	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	YMR295C	Q03559	197 aa		0.23	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	YPR203W	Q08994	102 aa		0.23	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	YLR422W	Q06409	1932 aa		0.22	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	PAM17	P36147	197 aa		0.22	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	FMP23	P38231	175 aa		0.22	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	YHL037C	P38733	133 aa		0.22	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	NAT3	Q06504	195 aa		0.22	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		0.22	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	TEL1	P38110	2787 aa		0.22	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	MRS1	P07266	363 aa		0.22	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	TIR1	P10863	254 aa		0.22	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	YPK2	P18961	677 aa		0.22	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	MGT1	P26188	188 aa		0.22	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	UBC8	P28263	218 aa		0.22	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	ARO7	P32178	256 aa		0.22	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	YBR242W	P38331	238 aa		0.22	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	YNL033W	P53964	284 aa		0.22	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	SHH3	Q04487	196 aa		0.22	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	YOL014W	Q08110	124 aa		0.22	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.22	□□□□□ -2.37
INP2	YMR163C	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	AIM2	P39721	246 aa		0.21	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	MTW1	P39731	289 aa		0.21	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	PGA2	P53903	129 aa		0.21	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	FUS2	Q05670	677 aa		0.21	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	GIS3	Q12418	502 aa		0.21	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	HTB2	P02294	131 aa		0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	SNF4	P12904	322 aa		0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	AHT1	P29589	182 aa		0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	SFK1	P35735	353 aa		0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	YFL051C	P43552	160 aa		0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	TDA4	P47153	279 aa		0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	YMR253C	Q04835	414 aa		0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	YCR023C	P25351	611 aa		0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	SPC25	P40014	221 aa		0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	MPM1	P40364	252 aa		0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	CUP9	P41817	306 aa		0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	YFL019C	P43576	117 aa		0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	MMS2	P53152	137 aa		0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	YNL184C	P53876	108 aa		0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	ARO80	Q04052	950 aa		0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	RNH1	Q04740	348 aa		0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	YLR031W	Q07978	186 aa		0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	GET4	Q12125	312 aa		0.2	□□□□□ -2.38
INP2	YMR163C	IRA1	P18963	3092 aa		0.19	□□□□□ -2.38

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