RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	ZRT1	P32804	376 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	PRM5	P40476	318 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	CAT5	P41735	233 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	TAD2	P47058	250 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	HMS2	P47175	358 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	BIO4	P53630	237 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YLR152C	P54072	576 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	IRC15	Q02733	499 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	INP1	Q03694	420 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	CRD1	Q07560	283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	BOL1	Q3E793	110 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YRF1-2	P40105	1681 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	COX10	P21592	462 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	ECM14	P38836	430 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	PEX22	P39718	180 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	PAU15	P40585	124 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	CTR1	P49573	406 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	DUG3	P53871	357 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YOL024W	Q08172	172 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YOR387C	Q08910	206 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	PRM3	Q08931	133 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	EAF3	Q12432	401 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YRF1-6	P53819	1859 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YIH1	P25637	258 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	MIG1	P27705	504 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	MRP17	P28778	131 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	AIM26	P32858	118 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	EMC3	P36039	253 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	SDT1	P53078	280 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	PRM8	P53174	237 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YNR071C	P53757	342 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YDR209C	Q03480	137 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	VBA1	Q04301	562 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	RIP1	P08067	215 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YIL054W	P40524	105 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	CTK2	P46962	323 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YGR219W	P53307	113 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	CAB4	P53332	305 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	AVO2	Q04749	426 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	ANT1	Q06497	328 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	HEM25	Q07534	307 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	COX1	P00401	534 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	SFT1	P43682	97 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	TTI2	P47168	421 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	GEP7	P53171	287 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	PDR17	P53844	350 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	PGA1	P53896	198 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	GAS3	Q03655	524 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YDR029W	Q12111	104 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	ICT1	Q12385	394 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	MHF1	Q3E835	90 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YOR338W	Q99326	363 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	MKK1	P32490	508 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	VMA11	P32842	164 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	MRPS5	P33759	307 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	ATG12	P38316	186 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	RPB11	P38902	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	VHT1	P53241	593 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	FIT1	Q04433	528 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YPL264C	Q08980	353 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	SWM1	Q12379	170 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	UBR1	P19812	1950 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	CWP2	P43497	92 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	PUS2	P53167	370 aa		4.78	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 44.3 ms