RNA–Protein interactions for RNA: YKR033C

YKR033C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR033C, Length 426 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR033CYKR033C RPB7P34087 171 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C YOX1P34161 385 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C YKL162CP36052 402 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C SHB17P36136 271 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C TRS20P38334 175 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C YHL044WP38727 235 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C YHL037CP38733 133 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C YEA6P39953 335 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C YEL057CP39983 233 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C PGD1P40356 397 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C YIL169CP40442 995 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C OST1P41543 476 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C YJR012CP47087 207 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C BNA1P47096 177 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C TTI2P47168 421 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C SSU72P53538 206 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C PDR17P53844 350 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C BUD25P85052 153 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C VPS28Q02767 242 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C ODC1Q03028 310 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C TMA23Q03525 211 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C TSA2Q04120 196 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C FIT1Q04433 528 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C YDL218WQ07629 317 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C PML1Q07930 204 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C YOR292CQ08743 309 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C FCY22Q12119 530 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C YPS3Q12303 508 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C EAF3Q12432 401 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C CMC2Q3E7A4 109 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C YBR298C-AQ8TGK4 73 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C YER175W-AQ8TGU4 54 aa2.37□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C MRP2P10663 115 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C MSI1P13712 422 aa2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C ATP10P18496 279 aa2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C APA2P22108 325 aa2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C SEC22P22214 214 aa2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C CNB1P25296 175 aa2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C IMP1P28627 190 aa2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C MRPL4P36517 319 aa2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C YBR220CP38318 560 aa2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C HSP10P38910 106 aa2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C PSD1P39006 500 aa2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C MOG1P47123 218 aa2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C SNN1P48232 102 aa2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C RIB4P50861 169 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C UBC13P52490 153 aa2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C MSO1P53604 210 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C FMP41P53889 259 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C YMR279CQ03263 540 aa2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C YMR082CQ04276 118 aa2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C LPP1Q04396 274 aa2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C RIM9Q04734 239 aa2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C ARR2Q06597 130 aa2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C YPL264CQ08980 353 aa2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C RAD28Q12021 506 aa2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C YGL194C-AQ2V2P6 80 aa2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C COX19Q3E731 98 aa2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C BOL1Q3E793 110 aa2.36□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C IPP1P00817 287 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C RPL9AP05738 191 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C BGL2P15703 313 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C RPB3P16370 318 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C TIP1P27654 210 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C ERG2P32352 222 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C SIP1P32578 815 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C MRPS5P33759 307 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C SWD3P38123 315 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C RIB5P38145 238 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C ICS2P38284 255 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C WSS1P38838 269 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C RMD6P39975 231 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C COX15P40086 486 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C FLX1P40464 311 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data2.35□□□□□ -2.03not detected
YKR033CYKR033C SAS2P40963 338 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C YJL118WP47022 219 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C ABM1P47146 123 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C UBP8P50102 471 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C RPL9BP51401 191 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C GEP7P53171 287 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C TIM21P53220 239 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C CRZ1P53968 678 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C HSK3P69852 69 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C MRP51Q02950 344 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C DCS1Q06151 350 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C YFH1Q07540 174 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C RRT7Q07829 113 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C SRL1Q08673 210 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C ATP14Q12349 124 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C YGL258W-AQ3E740 77 aa2.35□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C CYR1P08678 2026 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C ADH3P07246 375 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C PAU1P0CE88 120 aa2.34□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C PAU14P0CE89 120 aa2.34□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C PAU6P0CE90 120 aa2.34□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C PAU18P0CE91 120 aa2.34□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C PAU8P0CE92 120 aa2.34□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C PAU11P0CE93 120 aa2.34□□□□□ -2.03
YKR033CYKR033C YFL068WP0CX99 160 aa2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.7 ms