RNA–Protein interactions for RNA: YKL079W

SMY1, Transcript of Kinesin-like myosin passenger-protein, yeast

Gene SMY1, Length 1,971 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMY1	YKL079W	FES1	P38260	290 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	SHG1	P38337	142 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	AVT2	P39981	480 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	YER135C	P40082	130 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	YGL235W	P53071	178 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	1.01	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	RTC4	P53850	401 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	HSK3	P69852	69 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	YCR023C	P25351	611 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	CPR5	P35176	225 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	YET1	P35723	206 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	KDX1	P36005	433 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	VPS51	P36116	164 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	NVJ1	P38881	321 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	1.01	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	ERG25	P53045	309 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	YDC1	Q02896	317 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	NAT3	Q06504	195 aa		1.01	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		1	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	1	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	MRPS28	P21771	286 aa		1	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	MDH2	P22133	377 aa		1	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	SPO13	P23624	291 aa		1	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	UBC8	P28263	218 aa		1	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	CSH1	P38287	376 aa		1	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	SLM6	P38343	150 aa		1	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	1	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	1	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	FLO9	P39712	1322 aa		1	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	FIG1	P38224	298 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	YBR285W	P38354	144 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	KNH1	P50112	268 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	NUP49	Q02199	472 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	YLR036C	Q07986	203 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	YPR202W	Q08993	238 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	PET20	Q99373	253 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	AHC2	P25649	128 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	SNC2	P33328	115 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	AIM2	P39721	246 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	0.99	□□□□□ -2.25	not detected
SMY1	YKL079W	SER2	P42941	309 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	RDI1	Q12434	202 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	QCR2	P07257	368 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	SNF4	P12904	322 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	YKL102C	P34249	101 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	DER1	P38307	211 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	YEA4	P40004	342 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	AIM34	Q03673	198 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	SHH4	Q06236	168 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	YPR127W	Q06494	345 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	YLR031W	Q07978	186 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	YOL014W	Q08110	124 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	DGA1	Q08650	418 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	ODC2	Q99297	307 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	ATG40	Q99325	256 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	MGT1	P26188	188 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	UPS2	P35200	230 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	0.97	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	MTW1	P39731	289 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	FMP32	P43557	207 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	YFH7	P43591	353 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	BUD25	P85052	153 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	GPI17	Q04080	534 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	RNH202	Q05635	350 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.97	□□□□□ -2.25	not detected
SMY1	YKL079W	YBR220C	P38318	560 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	YFL019C	P43576	117 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	SBH2	P52871	88 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	0.97	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	PGA1	P53896	198 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	DYN3	Q04949	312 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	FYV12	Q08559	129 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	PEX11	Q12462	236 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SMY1	YKL079W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
SMY1	YKL079W	SEC11	P15367	167 aa		0.96	□□□□□ -2.26
SMY1	YKL079W	PHO85	P17157	305 aa		0.96	□□□□□ -2.26
SMY1	YKL079W	SFK1	P35735	353 aa		0.96	□□□□□ -2.26
SMY1	YKL079W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
SMY1	YKL079W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
SMY1	YKL079W	ORM1	P53224	222 aa		0.96	□□□□□ -2.26
SMY1	YKL079W	PLP1	Q04004	230 aa		0.96	□□□□□ -2.26

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