RNA–Protein interactions for RNA: YHR193C

EGD2, Transcript of Alpha subunit of the nascent polypeptide-associated complex (NAC), yeast

Gene EGD2, Length 525 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EGD2	YHR193C	HAL1	Q01766	294 aa		4.29	□□□□□ -1.72
EGD2	YHR193C	RBD2	Q12270	262 aa		4.29	□□□□□ -1.72
EGD2	YHR193C	SAL1	D6W196	494 aa		4.28	□□□□□ -1.72
EGD2	YHR193C	CYC3	P06182	269 aa		4.28	□□□□□ -1.72
EGD2	YHR193C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.28	□□□□□ -1.72
EGD2	YHR193C	MST28	P39552	234 aa		4.28	□□□□□ -1.72
EGD2	YHR193C	YAR068W	P39564	161 aa		4.28	□□□□□ -1.72
EGD2	YHR193C	RTT105	P40063	208 aa		4.28	□□□□□ -1.72
EGD2	YHR193C	IRC18	P47056	224 aa		4.28	□□□□□ -1.72
EGD2	YHR193C	MST27	P53176	234 aa		4.28	□□□□□ -1.72
EGD2	YHR193C	YGR042W	P53227	271 aa		4.28	□□□□□ -1.72
EGD2	YHR193C	MEH1	Q02205	184 aa		4.28	□□□□□ -1.72
EGD2	YHR193C	FMP42	Q04991	504 aa		4.28	□□□□□ -1.72
EGD2	YHR193C	AGC1	Q12482	902 aa		4.28	□□□□□ -1.72
EGD2	YHR193C	UBA3	Q99344	299 aa		4.28	□□□□□ -1.72
EGD2	YHR193C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	UPS2	P35200	230 aa		4.27	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	FMP23	P38231	175 aa		4.27	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	YBR184W	P38299	523 aa		4.27	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	POR2	P40478	281 aa		4.27	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	OTU1	P43558	301 aa		4.27	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	MAK3	Q03503	176 aa		4.27	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	VBA1	Q04301	562 aa		4.27	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	GPN3	Q06543	272 aa		4.27	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	CDS1	P38221	457 aa		4.26	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	STP4	Q07351	490 aa		4.26	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.26	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	ATG41	Q12048	136 aa		4.26	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	ATG31	Q12421	196 aa		4.26	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	RRT1	P38192	103 aa		4.25	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	RPR2	P40571	144 aa		4.25	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	MDJ2	P42834	146 aa		4.25	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	OCA2	P53949	197 aa		4.25	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	YML018C	Q03730	393 aa		4.25	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	RTT103	Q05543	409 aa		4.25	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	MCM21	Q06675	368 aa		4.25	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	TIM18	Q08749	192 aa		4.25	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	MET17	P06106	444 aa		4.24	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	SEC66	P33754	206 aa		4.24	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	RXT3	Q07458	294 aa		4.24	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	FEX1	Q08913	375 aa		4.24	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	FEX2	Q08991	375 aa		4.24	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.24	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	CAP2	P13517	287 aa		4.23	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	PHD1	P36093	366 aa		4.23	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	SNF11	P38956	169 aa		4.23	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	PCL6	P40038	420 aa		4.23	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	DFG10	P40526	253 aa		4.23	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	GNP1	P48813	663 aa		4.23	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	SGF11	Q03067	99 aa		4.23	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	RCF1	Q03713	159 aa		4.23	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	SIP1	P32578	815 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	FMT1	P32785	401 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	VMA22	P38784	181 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	GRX3	Q03835	250 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	MRPL35	Q06678	367 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	IZH3	Q07959	543 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	YLR031W	Q07978	186 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	LDS2	Q08218	356 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	VAM10	Q08474	114 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	PET20	Q99373	253 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EGD2	YHR193C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	YBL071C	P38185	102 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	PEX7	P39108	375 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	YAP1802	P53309	568 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	GIM3	P53900	129 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	KEI1	Q06346	221 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	PUP1	P25043	261 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	RNP1	P32385	249 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	RTS2	P40962	232 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	GPI2	P46961	280 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	SNX4	P47057	423 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	YIP3	P53633	176 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	EST3	Q03096	181 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	PAM18	Q07914	168 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	SCP1	Q08873	200 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	POP5	P28005	173 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	ILM1	P47155	203 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	YMR244W	Q04018	355 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	THI74	Q04083	370 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	SYM1	Q06563	197 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	ATG5	Q12380	294 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	ZRC1	P20107	442 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EGD2	YHR193C	YCR001W	P25347	104 aa		4.18	□□□□□ -1.74

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