RNA–Protein interactions for RNA: YHR014W

SPO13, Transcript of Meiotic regulator, yeast

Gene SPO13, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPO13	YHR014W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	YET1	P35723	206 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	UMP1	P38293	148 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	SWP1	Q02795	286 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	RRN5	Q02983	363 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	MSB2	P32334	1306 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	URA6	P15700	204 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	MSN4	P33749	630 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.98	□□□□□ -2.25	not detected
SPO13	YHR014W	GAS3	Q03655	524 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	YML108W	Q03759	105 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	RPL43B	P0CX26	92 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	SEC17	P32602	292 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	YER076C	P40049	302 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	PRM8	P53174	237 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	ALG13	P53178	202 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	0.97	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	UBC7	Q02159	165 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	YDR248C	Q03786	193 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	YPL162C	Q12042	273 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	MCP1	Q12106	302 aa		0.97	□□□□□ -2.25
SPO13	YHR014W	TIM9	O74700	87 aa		0.96	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	VAR1	P02381	398 aa		0.96	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	DBF2	P22204	572 aa		0.96	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	TCA17	P32613	152 aa		0.96	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	MRPL28	P36527	147 aa		0.96	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	NUP57	P48837	541 aa		0.96	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	SAY1	P53324	424 aa		0.96	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	CDC123	Q05791	360 aa		0.96	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	TSC3	Q3E790	80 aa		0.96	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	MIC26	P50087	233 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	BRR6	P53062	197 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	FYV6	P53913	173 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	STT4	P37297	1900 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	AQY2	P0CD90	149 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	TFC1	P32367	649 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	SNC2	P33328	115 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	MIC12	P38341	106 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	SIP3	P38717	1229 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	FAR7	P43592	221 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	KNH1	P50112	268 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	GPM2	Q12008	311 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	YMR31	P19955	123 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	YCL042W	P25572	119 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	APS1	P35181	156 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	YER085C	P40058	173 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	COX15	P40086	486 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	BXI1	P48558	297 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	TVP38	P36164	337 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	YBR209W	P38311	105 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	VMA22	P38784	181 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	ATG40	Q99325	256 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	SIR2	P06700	562 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.91	□□□□□ -2.26	not detected
SPO13	YHR014W	SSO1	P32867	290 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	YDR249C	Q03787	373 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	YDL180W	Q12301	547 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPO13	YHR014W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
SPO13	YHR014W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
SPO13	YHR014W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.9	□□□□□ -2.27	not detected
SPO13	YHR014W	SKG1	P36169	355 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SPO13	YHR014W	YBR285W	P38354	144 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SPO13	YHR014W	MOB1	P40484	314 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SPO13	YHR014W	YGR050C	P53231	118 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SPO13	YHR014W	PET191	Q02772	108 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SPO13	YHR014W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
SPO13	YHR014W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SPO13	YHR014W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SPO13	YHR014W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SPO13	YHR014W	TVP23	P38962	199 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPO13	YHR014W	YEL067C	P39978	195 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPO13	YHR014W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SPO13	YHR014W	YDR274C	P87283	123 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPO13	YHR014W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SPO13	YHR014W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPO13	YHR014W	SEY1	Q99287	776 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPO13	YHR014W	KSS1	P14681	368 aa		0.88	□□□□□ -2.27

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