RNA–Protein interactions for RNA: YGL211W

NCS6, Transcript of Protein required for uridine thiolation of Gln, Lys, and Glu tRNAs, yeast

Gene NCS6, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NCS6	YGL211W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NCS6	YGL211W	TRP1	P00912	224 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	CDC7	P06243	507 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	YGR050C	P53231	118 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	APS2	Q00381	147 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	CNL1	Q06333	122 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	PRR2	Q12310	699 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	MRS3	P10566	314 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	STP22	P25604	385 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	PHO89	P38361	574 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	AYR1	P40471	297 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	CLD1	P53264	445 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	TSC3	Q3E790	80 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	COX4	P04037	155 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	DDI2	P0CH63	225 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	DDI3	P0CH64	225 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	SPO13	P23624	291 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	MRP49	P32388	137 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
NCS6	YGL211W	MRPL17	P36528	281 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	SMP1	P38128	452 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	TVP23	P38962	199 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	TIM17	P39515	158 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	YPL073C	P40323	161 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	YIL024C	P40543	189 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	YFL067W	P43537	175 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	SNO3	P43544	222 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	PGA1	P53896	198 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	SAE3	P89114	91 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	VHS1	Q03785	461 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	MYO1	P08964	1928 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	ATR1	P13090	542 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	CNB1	P25296	175 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	UFD1	P53044	361 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	ORM1	P53224	222 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	YDR366C	P87287	132 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	FCY1	Q12178	158 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	YOR342C	Q12182	319 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	YOR214C	Q12282	236 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	PSF1	Q12488	208 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	YBR063C	P38083	404 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	CFD1	P40558	293 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	YFR054C	P43622	192 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	GAS3	Q03655	524 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	THI74	Q04083	370 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	ATX2	Q12067	313 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	TOM1	Q03280	3268 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	ERG2	P32352	222 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	CSE2	P33308	149 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	CSH1	P38287	376 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	DLS1	P40366	167 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	STB1	P42845	420 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	YGR039W	P53225	103 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	FMP48	P53233	369 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	YGR219W	P53307	113 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	SLM2	P53955	656 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	SML1	Q04964	104 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	FMP42	Q04991	504 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	MRX8	Q05473	314 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	AYT1	Q12226	474 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCS6	YGL211W	YHL026C	P38740	315 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCS6	YGL211W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NCS6	YGL211W	PRM5	P40476	318 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCS6	YGL211W	YGR015C	P53208	328 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCS6	YGL211W	YGR017W	P53210	297 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCS6	YGL211W	CAB4	P53332	305 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCS6	YGL211W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NCS6	YGL211W	AIM36	Q03798	255 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCS6	YGL211W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCS6	YGL211W	CRC1	Q12289	327 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCS6	YGL211W	YPS3	Q12303	508 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCS6	YGL211W	RTR2	Q12378	196 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCS6	YGL211W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.71	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 87.6 ms