RNA–Protein interactions for RNA: YER177W

BMH1, Transcript of 14-3-3 protein, major isoform, yeast

Gene BMH1, Length 804 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BMH1	YER177W	BDH1	P39714	382 aa		3.22	□□□□□ -1.89
BMH1	YER177W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
BMH1	YER177W	PGD1	P40356	397 aa		3.22	□□□□□ -1.89
BMH1	YER177W	GDS1	P41913	522 aa		3.22	□□□□□ -1.89
BMH1	YER177W	CIN2	P46670	268 aa		3.22	□□□□□ -1.89
BMH1	YER177W	SPC3	Q12133	184 aa		3.22	□□□□□ -1.89
BMH1	YER177W	POM33	Q12164	279 aa		3.22	□□□□□ -1.89
BMH1	YER177W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		3.22	□□□□□ -1.89
BMH1	YER177W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		3.22	□□□□□ -1.89
BMH1	YER177W	MHF1	Q3E835	90 aa		3.22	□□□□□ -1.89
BMH1	YER177W	RIB3	Q99258	208 aa		3.22	□□□□□ -1.89
BMH1	YER177W	FSH3	Q99369	266 aa		3.22	□□□□□ -1.89
BMH1	YER177W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
BMH1	YER177W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	SEC22	P22214	214 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.21	□□□□□ -1.9	not detected
BMH1	YER177W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	CUE1	P38428	203 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	RPS27B	P38711	82 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	BMT5	P40493	336 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	YIL086C	P40503	102 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	UFD1	P53044	361 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	YPS5	P53057	165 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	MRH4	P53166	561 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	HCH1	P53834	153 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	NUP49	Q02199	472 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	ABF2	Q02486	183 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	INP1	Q03694	420 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	OST6	Q03723	332 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	YDL012C	Q12489	107 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	SLO1	Q3E784	85 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	URA6	P15700	204 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	CPT1	P17898	393 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	PHO80	P20052	293 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	IFM1	P25038	676 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	ZRT3	P34240	503 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	IGD1	P43598	195 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	SNN1	P48232	102 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	NIF3	P53081	288 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	JAC1	P53193	184 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	YGR017W	P53210	297 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	TPC1	P53257	314 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	AIM34	Q03673	198 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	NAT4	Q04751	285 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	FRQ1	Q06389	190 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	YLR126C	Q12288	251 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	CSF1	Q12150	2958 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	SPS2	P08459	502 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	EHD3	P28817	500 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	MRPL6	P32904	214 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	SSS1	P35179	80 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	MRPS9	P38120	278 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	POP8	P38208	133 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	ECM34	P38728	170 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	RRG9	P40156	214 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	MPM1	P40364	252 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	TAD2	P47058	250 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	BRR6	P53062	197 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	YNR066C	P53752	436 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	MAK3	Q03503	176 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	PCC1	Q3E833	88 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	COA6	Q3E846	104 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	YOR304C-A	O14468	76 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	RNP1	P32385	249 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	YKL162C	P36052	402 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	TRR2	P38816	342 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	COG3	P40094	801 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	RFC2	P40348	353 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	PGU1	P47180	361 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	MIC26	P50087	233 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	MGA1	P53050	456 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	YGL101W	P53144	215 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	MMS2	P53152	137 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	IGO1	P53897	168 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	SAE3	P89114	91 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	SDH7	Q04401	133 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BMH1	YER177W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9

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