RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W AYT1Q12226 474 aa4.65□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W VPS13Q07878 3144 aa4.64□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W RPL12BP0CX54 165 aa4.64□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W MIR1P23641 311 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W RFA3P26755 122 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W FRM2P37261 193 aa4.64□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W MRPS9P38120 278 aa4.64□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W TRS20P38334 175 aa4.64□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W YBR292CP38357 123 aa4.64□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W RPR2P40571 144 aa4.64□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W PHS1P40857 217 aa4.64□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W YFR054CP43622 192 aa4.64□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W YNR066CP53752 436 aa4.64□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W CYT2Q00873 224 aa4.64□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W YOR343CQ12484 108 aa4.64□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W FUN14P18411 198 aa4.63□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W CPR5P35176 225 aa4.63□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W FIG1P38224 298 aa4.63□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W SUR2P38992 349 aa4.63□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W MOB2P43563 287 aa4.63□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W YMR082CQ04276 118 aa4.63□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W ARF1P11076 181 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W CDC50P25656 391 aa4.62□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W ALK2P32789 676 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W RPL14AP36105 138 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W SLM6P38343 150 aa4.62□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W RPL14BP38754 138 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W COQ5P49017 307 aa4.62□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W SLX9P53251 210 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W HCH1P53834 153 aa4.62□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W YML122CQ03207 126 aa4.62□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W YMR181CQ03231 154 aa4.62□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W FSH2Q05015 223 aa4.62□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W MIM1Q08176 113 aa4.62□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W TPT1Q12272 230 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W IZH2Q12442 317 aa4.62□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W YNR034W-AQ3E841 98 aa4.62□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W COA6Q3E846 104 aa4.62□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W YIL134C-AQ45U18 67 aa4.62□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data4.61□□□□□ -1.67not detected
VHS1YDR247W MSW1P04803 379 aa4.61□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W RPS14AP06367 137 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W PAU19P0CE85 124 aa4.61□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W PAU21P0CE86 164 aa4.61□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W PAU22P0CE87 164 aa4.61□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W SAG1P20840 650 aa4.61□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W MXR2P25566 168 aa4.61□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W PAU3P25610 124 aa4.61□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W ACP1P32463 125 aa4.61□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W RPS14BP39516 138 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W YJR012CP47087 207 aa4.61□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W SEH1P53011 349 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W COA2Q3E823 68 aa4.61□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W YLL053CP0CD98 152 aa4.6□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W YCR025CP25352 136 aa4.6□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W EHD3P28817 500 aa4.6□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W MNS1P32906 549 aa4.6□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W YKL097CP34245 136 aa4.6□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W UPS2P35200 230 aa4.6□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W SWD2P36104 329 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W PAU4P53427 120 aa4.6□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W PAL1Q05518 499 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W IRC19Q07843 230 aa4.6□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W FCY22Q12119 530 aa4.6□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W SME1Q12330 94 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W HMS1Q12398 434 aa4.6□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W RAX2Q12465 1220 aa4.6□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W AGC1Q12482 902 aa4.6□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W BGL2P15703 313 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W ERG2P32352 222 aa4.59□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W RPS27AP35997 82 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W MIX23P38162 196 aa4.59□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W YBR096WP38256 230 aa4.59□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W RPS27BP38711 82 aa4.59□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W PCL7P40186 285 aa4.59□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W SIM1P40472 476 aa4.59□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W OST1P41543 476 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W SMD3P43321 101 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W PAU5P43575 122 aa4.59□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W OST3P48439 350 aa4.59□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W ERG25P53045 309 aa4.59□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W MSO1P53604 210 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W YLR460CP54007 376 aa4.59□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W YDC1Q02896 317 aa4.59□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W LDS2Q08218 356 aa4.59□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W PRR2Q12310 699 aa4.59□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W ATG5Q12380 294 aa4.59□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W CYR1P08678 2026 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
VHS1YDR247W CDC28P00546 298 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W RPL25P04456 142 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W PAU1P0CE88 120 aa4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W PAU14P0CE89 120 aa4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W PAU6P0CE90 120 aa4.58□□□□□ -1.68
VHS1YDR247W PAU18P0CE91 120 aa4.58□□□□□ -1.68
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