RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)C

SUP53, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene SUP53, Length 82 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUP53tL(CAA)C DIE2P50076 525 aa2.6□□□□□ -1.99
SUP53tL(CAA)C PAU12P53343 120 aa2.6□□□□□ -1.99
SUP53tL(CAA)C SGF11Q03067 99 aa2.6□□□□□ -1.99
SUP53tL(CAA)C FIN1Q03898 291 aa2.6□□□□□ -1.99
SUP53tL(CAA)C LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
SUP53tL(CAA)C VIK1Q12045 647 aa2.6□□□□□ -1.99
SUP53tL(CAA)C YPR1Q12458 312 aa2.6□□□□□ -1.99
SUP53tL(CAA)C FUS3P16892 353 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
SUP53tL(CAA)C ATP3P38077 311 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
SUP53tL(CAA)C PAU24P38155 120 aa2.59□□□□□ -1.99
SUP53tL(CAA)C FMC1P40491 155 aa2.59□□□□□ -1.99
SUP53tL(CAA)C OCA2P53949 197 aa2.59□□□□□ -1.99
SUP53tL(CAA)C PRM7Q12459 698 aa2.59□□□□□ -1.99
SUP53tL(CAA)C BOL1Q3E793 110 aa2.59□□□□□ -1.99
SUP53tL(CAA)C YPR108W-AQ3E7B3 70 aa2.59□□□□□ -1.99
SUP53tL(CAA)C SRY1P36007 326 aa2.58□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C GPI14P47088 403 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C BXI1P48558 297 aa2.58□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C SLX9P53251 210 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C MSO1P53604 210 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C HUG1Q6Q5K6 68 aa2.58□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C CHO1P08456 276 aa2.57□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C YGL041W-AP0C5N3 154 aa2.57□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C CAP2P13517 287 aa2.57□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C MIR1P23641 311 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C CDC10P25342 322 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C SFK1P35735 353 aa2.57□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C WSS1P38838 269 aa2.57□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C SMB1P40018 196 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C GLE2P40066 365 aa2.57□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C YRB2P40517 327 aa2.57□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C YIL060WP40519 144 aa2.57□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C LCB3P47013 409 aa2.57□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C TMA22P47089 198 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C YDR286CQ05530 114 aa2.57□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C YFH1Q07540 174 aa2.57□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C TIM18Q08749 192 aa2.57□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C FEX1Q08913 375 aa2.57□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C FEX2Q08991 375 aa2.57□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C YLR365WQ7LIF2 110 aa2.57□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C CYC1P00044 109 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C SEN2P16658 377 aa2.56□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C YUH1P35127 236 aa2.56□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C YBR197CP38306 217 aa2.56□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C DOG2P38773 246 aa2.56□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C DOG1P38774 246 aa2.56□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C DFG10P40526 253 aa2.56□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C SNX4P47057 423 aa2.56□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C MRPS8Q03799 155 aa2.56□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C YMR130WQ04223 302 aa2.56□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C VPS63O13549 108 aa2.55□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C URA3P03962 267 aa2.55□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C PUP1P25043 261 aa2.55□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C RFA3P26755 122 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C PAU2P32612 120 aa2.55□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C PEP12P32854 288 aa2.55□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C POP2P39008 433 aa2.55□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C FCY21P40039 528 aa2.55□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C YER135CP40082 130 aa2.55□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C AIM20P40451 204 aa2.55□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C POR2P40478 281 aa2.55□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C NUP42P49686 430 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C ASI2P53895 289 aa2.55□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C USV1Q12132 391 aa2.55□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C YLR099W-AQ3E798 87 aa2.55□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C CYC7P00045 113 aa2.54□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C GDT1P38301 280 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C MED8P38304 223 aa2.54□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C RPS0BP46654 252 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C GPI2P46961 280 aa2.54□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C DOC1P53068 250 aa2.54□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C ARO8P53090 500 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C YIP3P53633 176 aa2.54□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C MET17P06106 444 aa2.53□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C MRP2P10663 115 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C IDP1P21954 428 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C IFM1P25038 676 aa2.53□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C YLF2P38746 405 aa2.53□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C PTC7P38797 343 aa2.53□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C THO1P40040 218 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C HXT14P42833 540 aa2.53□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C ARP3P47117 449 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C CTF19Q02732 369 aa2.53□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C VBA1Q04301 562 aa2.53□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C HNT1Q04344 158 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C YLR346CQ06139 101 aa2.53□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C HBN1Q96VH4 193 aa2.53□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C ODC2Q99297 307 aa2.53□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C YPL229WQ99395 206 aa2.53□□□□□ -2
SUP53tL(CAA)C RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C PET54P10834 293 aa2.52□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C PRE7P23724 241 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C POP5P28005 173 aa2.52□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C CDS1P38221 457 aa2.52□□□□□ -2.01
SUP53tL(CAA)C SNF11P38956 169 aa2.52□□□□□ -2.01
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