RNA–Protein interactions for RNA: YOR160W

MTR10, Transcript of Nuclear import receptor, yeast

Gene MTR10, Length 2,919 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTR10	YOR160W	YDR366C	P87287	132 aa		3.6	□□□□□ -1.83
MTR10	YOR160W	RHO4	Q00246	291 aa		3.6	□□□□□ -1.83
MTR10	YOR160W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
MTR10	YOR160W	ENB1	Q08299	606 aa		3.6	□□□□□ -1.83
MTR10	YOR160W	RAD28	Q12021	506 aa		3.6	□□□□□ -1.83
MTR10	YOR160W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
MTR10	YOR160W	ISD11	Q6Q560	94 aa		3.6	□□□□□ -1.83
MTR10	YOR160W	DYN1	P36022	4092 aa		3.59	□□□□□ -1.83
MTR10	YOR160W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
MTR10	YOR160W	YKR041W	P36134	250 aa		3.59	□□□□□ -1.83
MTR10	YOR160W	MET30	P39014	640 aa		3.59	□□□□□ -1.83
MTR10	YOR160W	YIL012W	P40551	113 aa		3.59	□□□□□ -1.83
MTR10	YOR160W	GWT1	P47026	490 aa		3.59	□□□□□ -1.83
MTR10	YOR160W	BOL2	P53082	120 aa		3.59	□□□□□ -1.83
MTR10	YOR160W	YML018C	Q03730	393 aa		3.59	□□□□□ -1.83
MTR10	YOR160W	YLR118C	Q12354	227 aa		3.59	□□□□□ -1.83
MTR10	YOR160W	TPK3	P05986	398 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	EXO70	P19658	623 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	INM1	P38710	295 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	PHO90	P39535	881 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	POP1	P41812	875 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	BUL1	P48524	976 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	RIM8	P53179	542 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	DAD3	P69850	94 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	YOL159C	Q08300	171 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	TFC7	Q12415	435 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	ATR1	P13090	542 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	NUP2	P32499	720 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	CDC5	P32562	705 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	PMU1	P36069	295 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	YBR096W	P38256	230 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	TAX4	P47030	604 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	TAD2	P47058	250 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	DAN1	P47178	298 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	YNL165W	P53891	406 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	YPL067C	Q02754	198 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	MRX11	Q03079	207 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	ECI1	Q05871	280 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	FLO9	P39712	1322 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	YCL002C	P25565	263 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	OAC1	P32332	324 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	SNN1	P48232	102 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	GPI15	P53961	229 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	YMR320W	Q04897	101 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	FCY1	Q12178	158 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	PHO85	P17157	305 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	FUN14	P18411	198 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	MXR2	P25566	168 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	PDC2	P32896	925 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	MBA1	P38300	278 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	YGL230C	P53074	147 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	MTM1	P53320	366 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	MRPL22	P53881	309 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	GAL83	Q04739	417 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	MMT2	Q08970	484 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	RHO2	P06781	192 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	YHR130C	P38834	111 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	XBP1	P40489	647 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	APQ12	P40532	138 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	XPT1	P47165	209 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	HHT1	P61830	136 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	KTI11	Q3E840	82 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	IGO2	Q9P305	131 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	UBC5	P15732	148 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	SSS1	P35179	80 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	YHR177W	P38867	453 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	FAR3	P46671	204 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	MNN5	P46982	586 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	LCB3	P47013	409 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	IRC18	P47056	224 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	MUP1	P50276	574 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	CLD1	P53264	445 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	BIO4	P53630	237 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	YLR152C	P54072	576 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	VPS28	Q02767	242 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	ORT1	Q12375	292 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	MHT1	Q12525	324 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	TOD6	P34219	525 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MTR10	YOR160W	OST2	P46964	130 aa		3.56	□□□□□ -1.84

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