RNA–Protein interactions for RNA: YLR347W-A

YLR347W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR347W-A, Length 141 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR347W-AYLR347W-A RPS12P48589 143 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A GRX5Q02784 150 aa2.37□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A VBA1Q04301 562 aa2.37□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A RNH202Q05635 350 aa2.37□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A LOA1Q06508 300 aa2.37□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A ARV1Q06541 321 aa2.37□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A PSF1Q12488 208 aa2.37□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A SEC16P48415 2195 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A YMR316C-AI2HB70 103 aa2.36□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A ERD2P18414 219 aa2.36□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A ERG2P32352 222 aa2.36□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A SUR2P38992 349 aa2.36□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A CUP9P41817 306 aa2.36□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A OST3P48439 350 aa2.36□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A PRM8P53174 237 aa2.36□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A FMP41P53889 259 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A SWP1Q02795 286 aa2.36□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A RRN5Q02983 363 aa2.36□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A SDC1Q03323 175 aa2.36□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A SEI1Q06058 285 aa2.36□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A YPR172WQ06608 200 aa2.36□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A RRT8Q08219 342 aa2.36□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A YAL064W-BO13512 126 aa2.35□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A HIS3P06633 220 aa2.35□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A SSA3P09435 649 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A CUP1-1P0CX80 61 aa2.35□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A CUP1-2P0CX81 61 aa2.35□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A CAM1P29547 415 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A YBR285WP38354 144 aa2.35□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data2.35□□□□□ -2.03not detected
YLR347W-AYLR347W-A THO1P40040 218 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A SOK1P40317 901 aa2.35□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A FAR7P43592 221 aa2.35□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A APS3P47064 194 aa2.35□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A NUP57P48837 541 aa2.35□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A MPC1P53157 130 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A NCE101Q02820 53 aa2.35□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A BRX1Q08235 291 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A AKR2Q12013 749 aa2.35□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A BTS1Q12051 335 aa2.35□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A SPC3Q12133 184 aa2.35□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A MDM32Q12171 622 aa2.35□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A TOR1P35169 2470 aa2.34□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A TRA1P38811 3744 aa2.34□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A YOL162WP0CF19 215 aa2.34□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A FBA1P14540 359 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A KSS1P14681 368 aa2.34□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A SNF6P18888 332 aa2.34□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A YPK2P18961 677 aa2.34□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A RAD51P25454 400 aa2.34□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A YOR062CP36025 268 aa2.34□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A NSG1P38837 291 aa2.34□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A PRE6P40303 254 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A PDS1P40316 373 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A GCN20P43535 752 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A YLR460CP54007 376 aa2.34□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A YDR209CQ03480 137 aa2.34□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A MIX17Q03667 156 aa2.34□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A CGI121Q03705 181 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A MIX14Q04341 121 aa2.34□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A YPL119C-AQ3E751 87 aa2.34□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A YOS9Q99220 542 aa2.34□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A RIB3Q99258 208 aa2.34□□□□□ -2.03
YLR347W-AYLR347W-A TEL1P38110 2787 aa2.33□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A POF1P25576 258 aa2.33□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A HSP30P25619 332 aa2.33□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A TIM12P32830 109 aa2.33□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A ECM4P36156 370 aa2.33□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A GVP36P40531 326 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A EMC2P47133 292 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A BAT2P47176 376 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A VMA10P48836 114 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A GPI8P49018 411 aa2.33□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A BRR6P53062 197 aa2.33□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A YNR062CP53748 327 aa2.33□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A YPL039WQ03080 316 aa2.33□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A SNZ1Q03148 297 aa2.33□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A YMD8Q03697 442 aa2.33□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A COX20Q04935 205 aa2.33□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A ATG38Q05789 226 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A YRA1Q12159 226 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A YBL112CQ3E7Y4 105 aa2.33□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A ISD11Q6Q560 94 aa2.33□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A KIN28P06242 306 aa2.32□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A PBN1P25580 416 aa2.32□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A YCR102CP25608 368 aa2.32□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A OAC1P32332 324 aa2.32□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data2.32□□□□□ -2.04not detected
YLR347W-AYLR347W-A RPS20P38701 121 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A ARN2P38724 620 aa2.32□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A YHR180WP38868 163 aa2.32□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A EGD2P38879 174 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A PAM16P42949 149 aa2.32□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A PGA1P53896 198 aa2.32□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A RSM10Q03201 203 aa2.32□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A DML1Q03652 475 aa2.32□□□□□ -2.04
YLR347W-AYLR347W-A OST6Q03723 332 aa2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.7 ms